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提取高斯log文件中的晗 熵 吉布斯自由能

已有 17355 次阅读 2014-9-15 11:11 |个人分类:DrugDesign|系统分类:科研笔记

Sum of electronic and thermal Energies 对应的是内能  不是熵



Sum of electronic and thermal Enthalpies 对应的是焓

Sum of electronic and thermal Free Energies 对应的是吉布斯自由能




默认温度是298k



焓的批量提取

grep "thermal Enthalpies" *.log

吉布斯自由能的批量提取

grep "thermal Free Energies" *.log


熵的提取

for i in $(ls *log);do echo -n $i"  S: ";grep CV $i -A2|tail -n1|awk '{print $4}';done





如果你优化了结构,计算了频率没有虚频,那你把H G S这三个参数也提出来分析。




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