乔中东
Operator是基因吗? 精选
2013-1-8 16:40
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标签:基因, 生物学, 学生会

   讲分子生物学的时候,很多学生会问我:基因的物质基础是核苷酸序列,其功能是通过其产物实现的的。但是operator没有产物,但是为什么要将其翻译为操纵基因呢?Operator是基因吗?本文就这一问题进行了综述,也欢迎大家拍砖!本文由闫晓梅老师和我共同撰写!


   国内对operator的翻译有很多版本。孙乃恩[1]、杨叶华[2]、杨焕明[3] 等主编或翻译的教材中,都将operator命名为“操作子”;朱玉贤[4]郜金荣[5]等主编的教材将其命名为“操纵区”;而大多数教材和相关英汉词典却将其翻译作为“操纵基因”[7-20]  Operator是基因吗?什么样的DNA序列才能够称之为基因呢?本文依据相关研究,总结如下。

1  基因概念的演化及定义

有关基因的概念,最早可以追溯到1866年,Mendel发表的一篇经典论文——《植物杂交试验》。在文章中,Mendel提出了控制一种特殊表型性状(如豌豆花色)的 “特征” 称为 “单位因子[6]1900年,英国内科医生Archibald E. Garrod爵士研究了一些人类的遗传性疾病,其中一种疾病是苯丙酸尿症这种疾病因尿液暴露于空气中变黑很容易鉴别,所以又称为黑尿症。Garrod认识到等位基因的隐性突变有时会引起正常代谢过程的缺陷,这样,基因的概念被定义为“一个突变基因,一个代谢通路的障碍”。1903年,Walters S. Sutton 发现染色体行为与遗传因子行为一致,提出了染色体是遗传因子的载体,因而将遗传因子定位于染色体上。1909年,丹麦遗传学家Wilhelm Johannsen提出用基因gene由达尔文提出的泛生子Pangene最后一个音节而来) 这个术语代替孟德尔的遗传因子,其意思与Mendel的遗传因子相一致。美国遗传学家Thomas Hunt Morgan通过大量的研究,在他撰写的《基因论》一书中指出,基因是决定遗传的化学物质,存在于染色体上,从而完善了基因的概念。1941George W. BeadleEdward L. TatumX射线诱导处理红色脉胞霉,通过对大量的红色脉胞霉突变株的筛选,将基因更准确地再定义为“一个基因,一个酶”的概念。后来人们发现,许多酶含有2个或几个不同的被独立基因编码的多肽,“一个基因,一个酶” 的概念随后被修正为 “一个基因,一个多肽”。此后,由于人们发现一个基因的最终产物可能是RNA分子,基因的概念再次被修正为 “一个基因,一个转录本” 20世纪40年代,美国科学家Edward Lewis发明了一种互补实验的技术。运用这种方法,Lewis提供一种可以操作的定义基因的方法。由此, Benzer S.将顺反子cistron)的概念引入到基因的概念中。现在分子遗传学界普遍将顺反子作为基因的一个同义词[3,6,9]

有关基因的结构,在1940年以前,人们一直认为基因就像是串在一条线上的珠子,重组只能在基因间发生,不能在基因内发生。基因既是基本的功能单位,它可以控制一个表型性状;也是基本的结构单位,基因内不能发生重组,也不能因突变而再分为亚单位。但是,到了1940年,Clarence Oliver报告了果蝇lozenge基因内可以发生重组。这一发现的重大意义既使人兴奋,也引发了很多争论。争论的结果是,核苷酸才是基因的基本结构单位,遗传物质的基本单位是不可以通过突变或重组再分的[6,9]

现在,人们将基因定义为携带有遗传信息的DNARNA序列的遗传单位。它是控制性状的基本遗传单位。基因通过指导蛋白质和RNA的合成来表达自己所携带的遗传信息,从而控制生物个体的性状表现。换句话说,基因就是编码一定基因产物的核苷酸序列,这些基因产物包括蛋白质和RNA。但是,随着科学的发展,人们又发现,这个定义并不能包括所有的情况。在此基础上,科学家们又对基因的定义进行了一些补充,(1) 在真核生物中,基因还包括转录本的5’ 3’非翻译区,内含子等成分;(2终产物为RNA分子的属于结构基因;(3重叠基因中的一些核苷酸序列属于2种以上的基因;(4由于剪切机制不同,外显子可以拼接成一组相关的,但序列不同的蛋白质蛋白质的同型异构,因此基因就可以定义为编码一套相关多肽的一个转录单位的DNA序列;(5在祖系染色体中,编码抗体可变区的DNA序列可能仅仅编码多肽的一部分,所以这些序列可以是基因也可以是基因的一个片段[6,9] 。总之,在基因的概念中,包含了两方面的意思:首先,基因的物质基础是核酸。其次,基因实现其功能必须要有一定的产物,也就是说基因一定要有产物才能发挥作用。那么,operator是不是基因呢?

2  操纵子的结构和各个成分的功能

1961年,法国科学家Francois JacobJacques Monod在阐明大肠杆菌Escherichia coli利用乳糖进行代谢的过程中,提出了一种负调控的乳糖操纵子Operon)模型。该操纵子模型的建立是分子遗传学发展史上的一座重要里程碑,它解释了原核生物基因是如何控制基因表达的。JacobMonod提出的大肠杆菌乳糖操纵子的结构如图1所示,包含如下几个成分:上游编码阻遏蛋白的调节基因I (inhibitor)、启动子(P, Promoter)、与启动子相邻的操作子O, operator)以及下游的一组结构基因lacZlacYlacA [5,6,9]

乳糖代谢调节基因lacI编码一个大小为360个氨基酸的阻遏物蛋白,LacI阻遏物蛋白的活性形式是四聚体。当缺少诱导剂的时候,阻遏物结合在操作子O上,阻止RNA聚合酶转录lacZlacYlacA,三个基因只表达低水平的背景酶活性。这种低水平表达的酶,对于乳糖操纵子的诱导是非常必要的。乳糖操纵子的诱导剂为异乳糖,异乳糖是乳糖经过β-半乳糖苷酶催化反应而产生的。异乳糖一旦生成,即结合在阻遏物上,使阻遏物从操作子O上释放下来,从而使lacZ, lacYlacA三个结构基因得以转录。

JacobMonod通过对大量大肠杆菌突变株的研究发现,lacI和操作子O的突变经常会导致乳糖操纵子中结构基因的组成性表达。其中,操作子O的突变仅对同一条染色体的结构基因的表达产生影响,而LacI的突变却既可以影响相同的染色体,也可以影响不同的染色体。因此,LacI编码一个可以扩散的具体的蛋白质,而操作子O,即operator不编码任何产物[15,17]



1、大肠杆菌乳糖操纵子的结构示意图

乳糖操纵子有结构基因(ZYA)、启动子(P)和操作子(O)组成,调控基因(I)有自己的启动子。Z基因 β-galactosidase,β-半乳糖苷酶; Y基因 β-galactoside permease,β-半乳糖苷通透酶;A基因 β-galactoside transacetylase β-半乳糖苷转乙酰酶


3  Operator不具备基因的全部条件

Operator与启动子相邻的另一个顺式作用元件。顺式作用元件就是那些参与基因表达调控的DNA序列,它们不编码任何产物,其影响一般仅限于同一条染色体。既然operator是顺式作用元件,那么它具有一定的核苷酸序列,但不编码任何产物。因此operator满足不了基因的这2个要素,它肯定不能是一个基因。 而反式作用因子则是参与基因表达的蛋白质,这些蛋白质可以结合到顺式作用元件上。对于乳糖操纵子来说,LacI是一个基因,它的产物作为反式作用因子与作为顺式作用元件的操作子即operator相互作用,对下游结构基因的表达产生影响。

显然, operator被翻译为 “操纵基因”是不合适的。Operator被翻译为“操作子” 或者“操纵元件”。由于在讲课的时候操作子和操纵子的发音容易混淆,所以我们在编写《分子生物学》教材的时候,将其翻译成“操纵元件”[6]了。

参考文献:

[1] 孙乃恩, 孙东旭, 朱德煦. 1990. 分子遗传学. 南京:南京大学出版社, 286(书)

[2] 杨业华. 2008.基因的分子生物学. 北京:高等教育出版社. 30(书)

[3] Watson, J. D. 等著,杨焕明等译. 2009. 基因的分子生物学. 北京:科学出版社,547(书)

[4] 朱玉贤,李毅,郑晓峰. 2007. 现代分子生物学. 北京:高等教育出版社,237(书)

[5] 郜金荣,页林柏. 2007. 分子生物学. 武汉:武汉大学出版社,310(书)

[6] 乔中东. 2012. 分子生物学,北京:军事医学科学出版社,356.

[7] 李明刚,2004. 高级分子遗传学. 北京:科学出版社, 646(书)

[8] Lewin, B.著,赵寿元译,2007. 基因精要. 北京:科学出版社, 285(书)

[9] Snustad, D. P. , Simmons, M. J.著,赵寿元,乔守怡译.2011.遗传学原理(第3版).北京:  高等教育出版社,546(书)

[10] 张玉静. 2000. 分子遗传学. 北京:科学出版社,230(书)

[11] 李振刚. 2000. 分子遗传学(第1 版). 北京:科学出版社,127(书)

[12] 李振刚. 2008. 分子遗传学(第3版). 北京:科学出版社,168(书)

[13] 徐晋麟,赵春耕,秦敏君. 2008. 现代英汉遗传学词典. 北京:科学出版社,292(书)

[14] Singleton, P. , Sainsbury, D. 著;马清钧,石成华等译. 2007.英汉微生物学与分子生物学词典(第3) . 北京:化学工业出版社,785(书)

[15] 全国科学技术名词审定委员会. 2009. 细胞生物学名词2版). 北京:科学出版社,110(书)

[16] 张光毅等. 1999. 生物化学与分子生物学. 南京:东南大学出版社,81(书)

[17] 张恒. 2007. 生物化学与分子生物学. 郑州:郑州大学出版社,407(书)

[18] 黄诒森,张光毅. 2008. 生物化学与分子生物学. 北京:科学出版社,223(书)

[19] 韩贻仁. 2001. 分子细胞生物学. 北京:科学出版社,448(书)

[20] 赵亚华. 2011. 分子生物学教程. 北京:科学出版社,259(书)


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