写在前面
一个miRNA可以调控多个靶基因,一个靶基因也可以被多个miRNAs所调控。根据映射关系,miRNA与靶基因是多对多(many-to-many)调控与被调控关系。这里多对多关系就隐含了miRNA之间存在协同互作来靶向下游基因,这就是今天要说的miRNA协作。
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社会协作
在谈论miRNA协作之前,先说说社会协作。根据定义,社会协作(collaboration或cooperation或coordination)是指在目标实施过程中,个人与个人之间、部门与部门之间的协调与配合,强调整体性。其内容分主要分为资源、技术、配合和信息四个方面的协作。详细词条见百度百科(https://baike.baidu.com/item/%E5%8D%8F%E4%BD%9C/6845385?fr=aladdin)。
举个简单例子,维基百科和百度百科就是资源和信息方面的社会协作成果,里面涉及很多人参与。一般来说,总体目标比较大,每个人擅长领域和分工又有所不同。因此,社会协作成为高质量完成总体目标的必然途径和有效手段。
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miRNA协作
宏观层次的社会协作大家都有所耳闻,也都知道其重要性。在分子层面,自私基因其实也存在协作(部分可以参考英国演化理论学者理查德·道金斯创作的经典著作《自私的基因》,图1)。其中,miRNA协作就是基因协作的一种。
图1 自私的基因
miRNA协作是指为完成特定生物功能,多个miRNAs以协调与配合方式靶向下游基因。先看个例子,图2表示mir-17-92家族中的多个miRNAs相互协作靶向下游基因,实现细胞增殖、细胞凋零和血管生成生物过程。需要注意的是,上游转录因子(E2F1、E2F2和 E2F3)也以协作方式调控mir-17-92家族。
图2 miRNA协作(Olive V, et al. Int J Biochem Cell Biol. 2010;42(8):1348–1354.)
后话
miRNA协作只是基因协作的一种,这种协作方式必然也在其他RNA分子中广泛存在。毕竟,单个基因的力量犹如蚍蜉撼树。
参考文献:
[1] Olive V, Jiang I, He L. mir-17-92, a cluster of miRNAs in the midst of the cancer network. Int J Biochem Cell Biol. 2010;42(8):1348-1354. doi:10.1016/j.biocel.2010.03.004
[2] Dawkins R, Davis N. The selfish gene. Macat Library, 2017.
更多背景知识如下:
1. miRNA是何方神圣?
11. miRNA靶基因识别
12. miRNA靶基因识别:下一步
14. miRNA靶基因之预测型数据库
15. miRNA靶基因之综合型数据库
16. miRNA靶基因之miRLAB
18. miRNA与TF互为调控
19. miRNA与人类疾病
20. miRNA靶基因与人类疾病
21. miRNA与EMT
号外,ceRNA可是miRNA介导的哦。为了便于交流,我们为miRNA介导的ceRNA研究在Frontiers in Molecular Biosciences杂志( 2020_IF = 5.246)整了个专刊,主题为“Computational Identification of ceRNA Regulation”。投稿链接:https://www.frontiersin.org/research-topics/24340/。
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