• 2014年12月24日 10:03:13 初稿

• 2015年11月12日 15:26:42 支持中心空洞, 输出gro与itp文件

• 2017年02月09日 12:19:48 感谢 陈建发 指出代码错误并修正

前几天的一篇博文中分享了一个在线的八面体创建工具, 很多人看了之后觉得很有用. 我今天再分享一个自己的小工具, 可用于创建简单的石墨烯构型. 方法的原理请参考以前的一篇博文石墨烯-建模-几何性质及力场模拟.

如果此工具对你的工作有所帮助, 请引用我的相关论文:

Jicun Li, Feng Wang; J. Chem. Phys. 146(5):054702, 2017; 10.1063/1.4974921; Water graphene contact surface investigated by pairwise potentials from force-matching PAW-PBE with dispersion correction.

尺度(基本单元)： 长      宽 (设为0时会根据长度自动计算, 生成尽可能正方的构型)
孔洞半径(Å)：      单元C-C键长(Å)：
孔洞中心点位置： 原子 键中点 碳环中心
竖直(Z方向)波动周期数：   X方向      Y方向      波动振幅(Å)
坐标随机涨落振幅(Å)：      X方向      Y方向      Z方向