Clin Infect Dis：H7N9核内基因多起源或发生多次重配

摘要：H7N9的核内基因多起源或者发生了重配。根据核内基因的不用lineages，可以把现有的H7N9分成9个不同的基因型（genotypes）。

H7N9有8个基因，分别是HA，NA，M，PA，NP，NS，PB1，PB2，其中HA和NA是膜蛋白，而另外6个位于核内，称为核内基因。

H7N9发生以来，很多H7N9株被测序，有必要研究其发生发展过程。根据5月23号EpiFlu数据库中的26株H7N9基因组序列构建系统进化树，除了NS形成一个单系群，其它5个核内基因有两个分支（lineages）或多个分支，表明它们多起源或者发生了重配。其中M，PA，PB1和PB2基因分别有分支与A/brambling/Beijing/16/2012聚集在一起。

M基因，之前研究显示H7N9只形成一个分支，不与brambling聚集在一起。我们的进化树显示M基因有两个分支（minor lineage  和major lineage ），其中minor lineage是新发现的 ，与brambling聚集在一起。综上，至少核内5个基因在过去发生重配。

根据这核内基因的不用lineages，可以把现有的H7N9分成9个不同的基因型（genotypes）。

基因重配能迅速的交换遗传物质，改变其功能，比如增强致病性，传播性等。有必要及时对禽流感数据进行分析，观察其遗传变化路线图，以帮助我们更好阻止其进一步传播和致病。

Zhang L, Zhang Z, Weng Z. Rapid Reassortment of Internal Genes in Avian Influenza A(H7N9) Virus. Clinical Infectious Diseases 2013;57:1059-61.

Clin Infect Dis.-2013-Zhang-1059-61 (1).pdf

PS：之前已经写过这个文章内容， 稍微改了下，做个宣传，多交流！