张亮生
H7N9最新进展--核内基因快速重配 (1)(文章新版本)
2013-6-21 19:34
阅读:5398
标签:H7N9, 重配, 核内基因

H7N9最新进展--核内基因快速重配

我们的最新研究工作


禽流感有8个基因,分别是HANAMPANPNSPB1PB2,其中HANA是膜蛋白,而另外6个位于核内,称为核内基因。

 

先前的研究表明核内6个基因单一起源,来自一个共同祖先H9N2;或者由于一个重配事件产生的,也就是来自两种H9N2,由NS基因和其它5个基因重配而来。

 

我们根据最新的H7N9数据构建系统进化树,显示HANANS在进化树形成一支,表明这三个基因是单一起源,与之前结果一致。而其它5个核内基因形成两个分支或多个分支,表明它们多起源或者发生了重配。其中MPAPB1PB2基因分别有分支与A/brambling/Beijing/16/2012聚集在一起,表明它们祖先可能是brambling,而其它分支可能是由于重配导致的。

比如M基因,之前研究显示H7N9只形成一个分支,不与brambling聚集在一起起。我们的进化树显示M基因有两个分支,有意思的是,新发现的分支与brambling聚集在一起。

 

综上,我们发现H7N9核内5个基因发生了重配。根据这5个基因的进化树,可以把现有的H7N9分成9个不同的基因型。随着越来越多的H7N9被测序,会发现更多的重配现象。

 

基因重配能迅速的交换遗传物质,改变其功能,比如增强致病性,传播性等。有必要及时对禽流感数据进行分析,观察其遗传变化路线图,以帮助我们更好阻止其进一步传播和致病。


此项工作已在线:

Liangsheng Zhang*, Zhenguo Zhang* and Zhiping WengRapid reassortment of internal genes in avian influenza A H7N9 virus. Clin Infect Dis. first published online June 20, 2013 doi:10.1093/cid/cit414

*共同通讯

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23788242

 

Clin Infect Dis.-2013-Zhang-cid-cit414.pdf




PS;CID最新影响因子是9.35,在传染领域排第二,嘿嘿。


接下来,我们还一篇延续这个工作的,等在线了,再来宣传下。谢谢!

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