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RNA sequencing shows no dosage compensation of the active X-chromosome
pp1043 - 1047
Yuanyan Xiong1,6, Xiaoshu Chen1,6, Zhidong Chen1, Xunzhang Wang1, Suhua Shi1, Xueqin Wang2,3,
Jianzhi Zhang4 & Xionglei He1,5。
这篇文章本身很有意义,今天稍微的看了下。从文章看来我觉得有两个创新点,
1。推翻以前认为X:AA(x染色体表达与常染色体的表达量)~1的观点,认为是0.5。
2。X:AA~1的观点是Ohno在1967年提出的假设,称为Ohno假设,传统芯片做出来的结果认为这个假设是对的,大家也就接受了这种观点。但是用RNA-Seq做出来的结果却不是,倾向于X:AA~0.5。这里面可能是传统芯片用杂交探针不敏感导致的,而RNA-Seq可能检测基因表达更敏感,就得出了反对Ohno假设的结论。这个可以说是从技术层面一个重要创新点。一个有名的假设,如果还得到实验的验证就更难推翻。至于实验的正确与否可能关心很少。
另外一方面也很有意义,通讯作者是中山大学前几年刚招进来的,很年轻的一位学者,当时他只是博士毕业,没有做博士后,中大就给了教授职位。除了这篇文章之外,前一段时间Xionglei He还有一篇第一作者的Nature genetics。
He, X., W. Qian, Z. Wang, Y. Li, and J. Zhang (2010) Prevalent positive epistasis in Escherichia coli and Saccharomyces cerevisiae metabolic networks. Nat Genet, 42:272-276. (Additional Supplementary Materials)。
这两篇文章的通讯作者都有He, X博士导师zhang jianzhi, 他今年发的文章巨多,稍微数了下,影响因子加起来有160分之多,真是佩服与尊敬,楷模。
RNA sequencing shows no dosage compensation of the
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GMT+8, 2024-6-5 10:39
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