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原始库包含23万对日本晴(日本晴的序列为tigrv5)和9311间的InDel数据,多态大小在2bp以上。这个数据库可能还有点不太好用,数据量比较大,有冗余数据(下载地址:http://yunpan.cn/Qz3wgRV8CzhsN)。
在这个的基础上又产生了一个只包含基因的InDel数据的子集。最近又从中进行了进一步的细化和完善。按每kb选一个InDel标记,然后用stssearch工具,确定引物在9311基因组和日本晴IRGSP V4基因组中的位置,根据在两个基因组的PCR扩增片段大小生成多态数据,提取两个基因组相应序列,进行序列比对,这批标记可能是最好用的(这个数据库可以在这里获得:http://yunpan.cn/Qz3wz8SrA33Jp)。
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