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再谈基因组定点修饰技术

已有 6846 次阅读 2013-9-17 00:00 |个人分类:分子育种|系统分类:科研笔记| 基因组, 技术

     接上篇http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=479743&do=blog&id=725241.我确实不知道

中文的译法,在我的博文姑且这么叫,关键要真正理解这种技术.

     今天,扫了一眼这篇文章:Demonstration of CRISPR/Cas9/sgRNA-mediated targeted gene modification in Arabidopsis,tobacco, sorghum and rice.这个技术关键是要把这样一个载体转入到水稻中(以水稻为例).

    上图中的Cas9,是一个用来切割DNA的酶,sgRNA gene主要用来确定修饰哪个基因或者这个基因的哪个片段,确定方向的序列片段为20bp.从这个图可以看出,Cas9可以通用,而sgRNA需要根据研究的目标基因来设定.

把这个载体通过农杆菌介导的遗传转化技术转入到水稻后会发生什么?

   这个图里显示的是,把GFP作为修饰的目标基因.

    把上述载体的转基因水稻中,在Cas9/sgRNA的作用下,水稻里的目标基因就会受到修饰(修饰哪个基因由载体中的sgRNA决定.).考虑这个转基因水稻的基因型.假设T表示转入了上述载体.那么T/T,和T/t类型的转基因植株都会发生目标基因的定点修饰事件.如果是T/T的话,其后代也会发生目标基因的定点修饰.如果是T/t,则后代里有t/t的类型,这种类型就是所谓的Transgene free的类型了.这样的单株,有可能既产生了定点变异,又没有任何转基因的成分.那么通过这样的定点修饰,有可能产生,同一个基因的非常多的等位基因,这无论是对育种还是分子生物学理论研究,都有重要的价值.其中一个关键可能是这20bp的决定方向的DNA.如果这20bp,在基因组中是多拷贝的,那么可以同时修饰多个基因组区域.或者同时转入多个sgRNA,也可以同时修饰多个基因.

   可能产生什么样变异?

SNP InDel.

      这个技术好象很有商业价值,有很多的基因或者是等位基因可以做成相应的产品,好象有点意思.

 



https://wap.sciencenet.cn/blog-479743-725506.html

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