Genotype–phenotype mapping in a post-GWAS world

    呵呵,这篇文章出现了一个新词(对我来说比较新):post-GWAS.的确应该考虑后关联作图时代的问题了.GWAS的问题是什么呢?Genome-wide association studies (GWAS) statistically connect genotypes to phenotypes, without any
recourse to known molecular interactions.仅仅从统计的角度建立基因型和表型间的联系,而不考虑真实的分子或基因间的互做.分子生物学的方法才会考虑.文中表述为:whereas a molecular biology approach directly ties gene function
to phenotype through gene regulatory networks (GRNs).

    所以,得把这两个东西放在一个统一的框架下一并考虑.这个框架叫:structural equation modeling (SEM).效果怎样还得继续观察.这也不是一般的研究单位或团队能玩的起的.

    在我看来还有另一种玩法.不玩全基因组的,抓重点逐个攻破.对植物而言,除了GWAS还有经典的连锁作图方法可以利用.

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