羊肚菌是一种美味的野生食用菌，有两个与羊肚菌属形态极其相似的属（鹿花菌属和钟菌属）的一些种是有毒的。上图给出了一个简单的区分这三个属的特征描述：菌柄（stem）与菌盖（cap）交接的位置。如上图。

        羊肚菌的菌柄与菌盖交接处在菌盖的下沿或中间（半高羊肚菌 M.semilibera）；

        鹿花菌和钟菌属的种菌柄与菌盖的交接处在菌盖的顶部。

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