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viennaRNA package 安装

已有 10901 次阅读 2014-8-11 17:16 |个人分类:bioinformatics|系统分类:科研笔记



(1)转到该 网址网站 http://www.tbi.univie.ac.at/RNA/


(2)找到你需要的版本代码。例如选择ubuntu

下方出现两种方法。

(2-1)使用ppa法

sudo apt-add-repository ppa:j-4/vienna-rnasudo apt-get updatesudo apt-get install vienna-rna

或者

(2-2) 下载相应的ubuntu的二进制文件:

ViennaRNA Package v2.1.7 (deb, Debian/Ubuntu, 64bit) [3.5MB]
ViennaRNA Package v2.1.7 (deb, Debian/Ubuntu, 32bit) [8.1MB]
ViennaRNA Package v2.1.6 (deb, Raspbian, 32bit ARM/soft-float) [8.6MB]

(如有版本更新,请到http://www.tbi.univie.ac.at/RNA/ 下载最新版本)

(3)命令行下:

RNAfold  < rna.seq(序列文件名) >rna.ss (预测结果)




https://wap.sciencenet.cn/blog-468005-818389.html

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