自由的核子是如何聚集在一起形成原子核的，是核心的问题。这里的困难在于核子本身是复合粒子，是由价夸克、胶子、海夸克通过量子色动力学作用出现的复杂粒子。和质子电子通过电磁作用吸引在的区别在于，这个核子的色禁闭看起来怪怪的。质子和电子构成电中性的氢原子，主要是质子和电子。而三个价夸克构成核子，却只是一部分，甚至很少的一部分。然后也是形成了色中性的粒子。
所以质子和电子以外只是非常少的光子，以及电子对。而核子中，三个价夸克以外，却产生了很多的胶子和海夸克。所以，当核子构成原子核的时候，出现了很多可能性。
原子构成分子或者凝聚态的物质，关键是原子的重排，电子和里边的惰性部分会出现变化。而当核子构成原子核的时候，价核子、胶子和海夸克就都有可能出现变化。在讨论核力的过程中，一个早期的贡献就日本科学家汤川秀树提出了核子之间通过π介子作用。
当时考虑这个问题的时候，是对比电动力学的，现在已经知道这个图景是错误的。但是这π介子一直是存在的，而且一直在核力中扮演着重要角色。
核子形成原子核，是要损失一部分能量的。所以原来自由核子内的成分，自然会减少一些，或者能量要降低一些。价核子是不能少的，与价核子相关的胶子也不能少，但是额外的海夸克和相应的胶子都可以少一些。
关键的是，减少动能。在原子结合成化学键的时候，电子的动能减少了。组成原子核后，这些核子的组分都可以有更大的运动空间，这是关键。
通过交换π介子，质子可以变为中子，中子可以变为质子。这是一个非常重要的事情。质子或者中子，也可以通过介子彼此作用。可以看到，这是一个各组分的重新分组。比如质子变成中子，原来质子中有三个价夸克（两个上夸克和一个下夸克）、胶子和海夸克，然后分裂了，出来了一个正电荷的π介子和一个中子。中子的价夸克是两个下夸克和一个上夸克。也就是原来的一个夸克对和原来的三个价夸克重组了。
中子变成质子也是如此。质子也会抖一抖，分离出一块中性的π介子，然后被其它的核子吸收。我现在就是没太搞清楚，这个很容易理解的图景，是怎么和夸克的手征对称破缺联系上的。感觉似乎真的不需要什么对称破缺（当然这是必须的）。
能够分裂成什么，感觉更是色禁闭的结果。
所以能看到，这些核子是很容易重组的。这也是核子结合成原子核的关键。有着更大的体积，核子中的一部分，会更容易形成π介子，形成核力。看起来和色禁闭没有什么关系，所以也谈不上什么色自由度。
但是，很显然，形成的是π介子这样的色中性的粒子，而不是什么别的粒子，是色禁闭的结果。所以在核子分出π介子的时候，谁知道有什么更细微的机制呢？
当然更重要的就是夸克和胶子的直接转移，这一点在以前是没有被重视的。直到EMC效应发现以后，才知道原子核中核子的夸克的动量减少了。这意味着夸克在更大的体积内运动。
其实按照道理说，上下夸克的质量和胶子的静止质量都很小，胶子甚至是没有静止质量的。所以这些粒子可以有很大的康普顿波长，所以在很大的距离内发生跳跃是很容易的事情。
所以只要原子核是色中性的，似乎没有违反什么规律。
所以原子核中的核子出来单个的夸克或者胶子，完全看不出来有什么不可以。而这是低能核结构一直被忽略的地方，也是核力的研究中很少考虑的地方。
所以原子核中的核子作用，可以分为两类。一类是色中性粒子的传递（由于手征对称性破缺），一类是夸克和胶子的直接传递，这两者之间可能有关系，但是具体是什么依然不清楚。最近我提出认为应该往前迈出这一步，要考虑带色的核子和介子，也许是有价值的。
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