人类体内拥有数万亿个细菌，5年来，关于菌群的研究已经吸引了5亿美元左右的研究经费，同时也推动了粪便移植等采用细菌治疗严重炎症性疾病的治疗方法。
菌群的研究让科学家提出更多通过干预人体细菌提高健康和治疗疾病的方法，也引起许多大型医药企业的兴趣。
5月2日，辉瑞宣布和加州第二基因组（Second Genome）公司合作开展代谢综合征的元基因组研究，该研究将大约招募900名受试者。并增加1千万欧元风险投资用于炎症／肝病和菌群关系的研究，开发相关诊断方法。
专家预测最近将会有更多这种投资大量增加，新的细菌组学相关药物会治疗将在近年内进入临床应用。
益生菌现在近几年已变得非常流行。电视广告兜售含双歧杆菌的酸奶，消费者热衷于服用乳酸桿菌药片以平衡自己肠道菌群治疗相关疾病。尽管许多医生或科学家怀疑这种方法的有效性。如梅奥诊所胃肠学Joseph Murray家说“益生菌虽然相对安全，但是对疾病症状没有针对性。”随着对特定细菌影响身体机制理解的深入，许多科学家认为，正确的细菌组合能对不同疾病状态进行针对性治疗。也有科学家开发小分子药物，来模拟细菌对机体的作用或阻断有害菌。斯坦福大学微生物学家Justin Sonnenburg认为“细菌就是体内的小药厂”。
Murray的研究小组已经报道，给转基因动物喂Prevotella histicola细菌能抑制炎症反应，治疗多发性硬化和类风湿关节炎。他们希望和Miomics合作开发这种治疗方法。Vedanta Biosciences公司也开展了口服细菌药丸抑制炎症的临床前研究。
去年6月，第二基因组公司宣布和比利时杨森公司合作研究结肠炎的肠道菌群，并希望开发针对性治疗药物。第二基因组公司总裁Peter DiLaura说他们希望寻找能通过影响菌群治疗糖尿病和自身免疫性疾病的小分子和生物制剂。该公司顾问，加州大学生物工程学家Michael Fischbach正在开发诊断特定细菌类型的小分子标志物，并筛选出能影响人体免疫系统的细菌小分子药物。
改变肠道内有益菌和有害菌的平衡能影响健康，甚至治疗抑郁症和焦虑。科学家已经有多种能改变这种平衡的手段和药物。一些不被人体吸收的小分子物质能特异性作用于肠道细菌。Sonnenburg小组已经发现，一种小分子唾液酸是有益菌在使用抗生素时自我保护的工具。他们希望寻找类似化合物以帮助恢复正常菌群平衡(K. M. Ng et al. Nature502, 96–99; 2013).。
菌群治疗公司目前正在开展的一项临床研究，是观察一种选择性增加有益菌的小分子对糖尿病治疗的效果。公司CEO Steven Orndorff说他们计划下月在芝加哥内分泌学大会上公布研究结果。也有一些公司开发相关诊断方法。Enterome已经建立一种基因序列分析平台检测粪便细菌类型以诊断和预警结肠炎等疾病。小分子可以通过传统的药物申报程序获得批准，但基因修饰细菌则需要新的规则。
过去这个领域的研究经费主要来自政府投入，现在的情况已经发生改变，企业的热情将会大大推动这个领域的快速转化应用。
http://www.nature.com/news/microbiome-therapy-gains-market-traction-1.15210
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