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GSASII-GSAS软件的新版本的安装使用

已有 44741 次阅读 2012-7-3 12:36 |个人分类:粉末衍射晶体结构分析|系统分类:科研笔记

今天收到一份转发的邮件,原文是阿贡实验室的Brian H. Toby博士写的,大意如下:

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大家好,

       这是为了让你知道(如果你还没有听说过)已有新的GSAS-II软件供大家试用。 GSAS-II是一个还在开发中的完整的晶体学软件包,可在Windows,Linux和MacOSX机器上运行(是在Windows上开发的,所以在Windows上运行最好)。GSAS-II大量使用计算机图形作为一个用户界面也用来显示结果。要找相关信息可用http://tinyurl.com/GSASII,或者用谷歌搜索“GSAS-II”,它可能就是搜索结果列表的第一项。

      GSAS-II将读取和处理X射线和中子(现只用于固定波长的)的粉末数据,多数情况下可以是任意老版本的GSAS文件格式,或IUCr CIF格式的单晶数据。它也可以读取和处理(例如校准和积分)2维图像粉末数据。粉末数据处理包括峰形拟合、指标化、Rietveld和Pawley精修。单晶数据可用于联合或单独精修。该系统包括绘制和显示傅立叶图,寻峰和用多种形式显示晶体结构(球,球棒,椭球体,多面体),以及给出估计标准偏差值的原子间距/角度/扭转角/平面几何计算数据。根据需要,可对参数使用刚性约束(constraints)关系和方程。也有计划开发对单晶或粉末衍射数据(需要下一步的工作来完成)进行电荷反转结构求解。更多的工作还计划添加柔性约束(restrains)和刚体精修。中子飞行时间数据和磁/无共度/蛋白质结构的分析处理的计划也在考虑。

        GSAS-II在阿贡实验室的的一个服务器上发布,由Python源代码,一些Fortran源代码(对于大多数平台上已编译过)和库模块,一套教程,和示例数据文件构成。它需要的Python 2.7 +(但不是Python3.+)和某些Python包(wxPython, numpy, scipy, matplotlib 和 pyOpenGL等)。

     完整的安装及操作说明,请参阅wiki页面。

       如果你尝试使用,请告知程序作者你的体验,尤其是如果你发现程序的错误。欢迎提出建议。

     也有GSAS-II全新邮件列表,请参阅http://www.aps.anl.gov/mailman/listinfo/GSAS-II;我们要求用户注册。

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     GSASII在Windows系统上的安装运行比较简单,主要包含以下的步骤:

(1)下载并安装Python包,我选择了从http://www.enthought.com/products/edudownload.php下载。在该网页页面下方的Academic e-mail 处填入e-mail地址,就能得到免费下载网址。

(2)下载并安装TortoiseSVN包,http://tortoisesvn.net/downloads

(3)在磁盘上建立一个GSASIII目录。鼠标右键点击目录名,在出现的菜单里选SVN Checkout项,就弹出对话框,在其中顶部的URL of repository的框内输入(也可能自动出现)地址https://subversion.xor.aps.anl.gov/pyGSAS/trunk,点击下方的“OK”就开始下载GSASII的所有文件。

(4)在GSASII的文件夹了点击GSASII.BAT就能运行了。更多细节可参考https://subversion.xor.aps.anl.gov/trac/pyGSAS/wiki/TortoiseInstall



https://wap.sciencenet.cn/blog-40265-588475.html

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