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刘学武先生今天提出了一个新的系统生物学研究思想:“放弃低层级的复杂结构”。他提出:“最近我也在研究这个系统生物学,包括复杂自适应系统。我感觉已有的理论还是在走还原论的老路,比如系统生物学通过高通量手段似乎要穷尽各个层级各个变量的关系。我认为这是不可能实现的。像薛定谔所提出的负熵之生命本质的优美而简单理论应该是系统生物学追求的目标,而非穷尽所有变量而构建一个庞杂系统模型来的要好。
如同复杂科学的数学建模原则,总是舍弃一些细节,抓住主因变量因素,系统生物学所研究的变量更应该舍弃那些互相抵消或琢磨不通的变量。所有我提一个系统生物学方法思路(希望前人没有提到过):按照不同层级来研究复杂系统,层级之间设定区隔。按照人的能力只研究那些人可以干涉并达到目标的层级。如果某一层级变量太多,结构复杂,超过人类研究计算能力或于干涉来说无法做到完全监控,那么就向上提高一个层级。比如如果基因组研究太复杂,那么提高到蛋白质层级,还不行,那么就提高到细胞层级。在细胞层级做研究就不需要考虑基因或蛋白层级的变量,只考察他们的平均变量。”
刘大侠的这个删繁就简,放弃“低层次”的想法恰好就是我二十年来为之努力奋斗的工作。于是提笔评论如下,现将评论转来自己的博客中,与大家商榷:
基因与蛋白质应该算同一个层级——生物大分子层级。从这个层级更深入一步便是亚分子功能团层级(生命科学的真正密码层级),这才是分子生物学的关键层级,也是我衰老学说落脚的层级,可参阅我有关博文中的链接。仔细看那张衰老研究层级“五级联络图”。生命科学从这个层级走出了复杂的微观世界,借助药物化学的精确时空隧道穿越回到了宏观生物天地。
从这张图您觉得,对于衰老本质的认识,我们是更上了一层楼呢还是更下一层楼了呢?
若是觉得下楼不爽,似乎钻进了更复杂的“繁文缛节”之中,那就请您钻进下一篇论文里,请看论文的图一,在那里您可是“更上一层楼”,可以忽然间走出生命的迷宫,看到衰老科学天亮的曙光喔!
The essential mechanisms of aging, What have we learnt in ten years.pdf
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GMT+8, 2024-12-27 23:17
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