黄皮（Clausena lansium）是一种重要的常绿果树，原产于我国华南地区，其药用价值具有悠久的历史。本研究构建了黄皮（C. lansium）染色体水平基因组，其大小为282.9 Mb，scaffold N50达到30.75 Mb。组装后的基因组包含48.70%的重复元件和24,381个蛋白质编码基因。比较基因组分析表明：黄皮（C. lansium）在约1591 - 2495万年前从柑橘亚科（Aurantioideae）分化而来。在扩张和特有基因中，鉴定出一批与甲基转移酶活性和S-腺苷蛋氨酸依赖性甲基转移酶活性相关的基因。进一步分析表明，N-甲基转移酶（NMT）主要参与生物碱的合成，而O-甲基转移酶（OMT）则参与黄皮香豆素积累的调控，推测黄皮富含生物碱和香豆素的重要原因可能由于NMT和OMT的基因扩张所致，其中串联重复事件是NMT扩展的主要原因。因此，黄皮（C. lansium）参考基因组发布将推动黄皮资源药用化合物发掘及其生物合成通路解析。
Yongzan Wei, Yi Wang, Fuchu Hu, Wei Wang, Changbin Wei, Bingqiang Xu, Liqin Liu, Huayang Li, Can Wang, Hongna Zhang, Zhenchang Liang, Jianghui Xie. 2024. The Clausena lansium genome provides new insights into alkaloid diversity and the evolution of the methyltransferase family. Journal of Integrative Agriculture, 23(10): 3537-3553.
Journal of Integrative Agriculture (《农业科学学报》(英文), JIA) 由中华人民共和国农业农村部主管，中国农业科学院与中国农学会主办，中国农业科学院农业信息研究所承办。综合性英文学术期刊，月刊。创刊于2002年，现任主编为中国科学院院士陈化兰。JIA主要栏目有作物科学、园艺、植物保护、动物科学、动物医学、农业生态环境、食品科学、农业经济与管理等。刊稿类型有综述、研究论文、简报以及评述等。全部论文在Elsevier-ScienceDirect (SD) 平台OA出版。最新SCI影响因子4.6，位于SCI-JCR农业综合学科Q1区。中国科学院分区农林科学1区。2016年以来先后获得中国科协等部委 “提升计划”“登峰计划”“卓越计划”项目支持。
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