蕨类植物是一个很有趣的类群，或者说是一个不怎么纯粹的类群，在某种意义上说，可以把一些蕨类植物独立出来，与裸子植物和被子植物并列。从其有性生殖来看，蕨类植物的某些类群只产生一种孢子，而一些类群会产生两类孢子。而且产生两类孢子的类群，也存在两种形式，一种是两种产孢器官分别在不同的分枝上，一类则在同一个分枝上，结合裸子植物全是雌雄异株或虽雌雄同株但却异枝，而被子植物多是雌雄同株、同花，而雌性异株或异花，不仅是少数，且大部分是次生现象，即为后来出现的，是由雌雄同花演化而来的，由此可以推测，一些现存的蕨类植物，以及裸子植物和被子植物分别都是从早先的蕨类植物演化出来的，只是两类种子植物的分化要晚于现存某些蕨类植物的分化，即现存某些蕨类植物的祖先与后来演化出两类种子的蕨类在比较早就分别演化了，因而产生两类种子植物的蕨类植物以及新获得了一些性状，这些性状为其向种子植物的演化奠定了基础，随后两类种子植物又各自演化，分别形成了裸子植物和被子植物。