认识世界有两条途径，一条是哲学的思辨，一条是科学的观察。哲学可以为科学提出原理，指明科学发展的方向，科学则可以验证这些原理，并为新原理的提出提供新的依据，两者是相辅相成、缺一不可的。可在当代科学界，两者却一直是格格不入的，原因就在于西方科学过去太成功了，从而使科学家们迷信于精密仪器的观察，从此不再相信哲学的思辨这种仅仅是猜想的东西。
事实上，哲学并不是空洞的想像，它有坚实的自然科学基础，这就是物质世界的统一性。它告诉我们，人和万物一样，不仅由同一种物质组成，也由同一个原理支配，因此，人存在与发展的原理就是万物存在与发展的原理，认识了自己，也就认识了自然。哲学就是一门通过认识自己存在与发展的原理，来总结大自然最普遍规律的学问。
显然，哲学方法本质上就是系统方法，它根据万物在运动原理上的统一性，通过系统间的类比来认识万物。有了这种方法论，我们就可以从宏观系统来认识微观系统，从可观察的系统现象来认识不可观察的系统现象，进而得到对自然更本质的认识。
现在已经到了将哲学与科学有机结合起来的时候了，而它必然会推动新一轮的科学革命，而这场科学革命的领头羊就是系统科学，它是科学与哲学有机结合的产物。
系统科学是一门一通百通的科学，因为自然界的一切物质存在都是呈系统的，上至星系、星体，下至分子、原子，中至生物、人、人类组织，它们都是物质系统，遵循着同一个系统学规律，只要将这个规律揭示出来，就可以用它解释自然界一切物质系统的存在。
西方科学看似富丽堂皇，其实它整体就是建立在一个错误的前提假设之上，它一是不承认物质在空间中的连续性，使生命问题永远不可认识，二是不承认物质彻底的统一性，使普遍联系问题永远不可认识，没有了这些核心问题的解决，西方的系统科学就是一个没有灵魂的空架子，它解释不了任何系统秩序的存在。
科学从来不是真理，它都是建立在假设之上的一门学问，前提假设越接近自然事实，科学理论越接近真理，科学就是在前提假设不断接近自然事实的基础上进步的。科学最早的前提假设就是牛顿的绝对时空观，它其实是原子说假设的一个变体，即认为空间空无一物和对称，以及万物是由少数几个基本粒子组成的。没有这个假设，牛顿力学和万物引力定律就不可能成立。比如，如果相互作用的物体不是死的质点，而是活的物质系统，它们在受到力的作用后都应该是整体性反应，此时牛顿第二、第三定律就不成立了。之后的前提假设则是以太观，它不过是在原子说假设的基础上给空间安上了一种特殊物质叫以太罢了；再后的前提假设就是爱因斯坦的局限对称的时空观，它重新回到了原子说假设，只不过粒子变得更小了罢了。
真正更接近自然事实的前提假设是中国的气一元论，在此基础上重建西方科学，一个更接近真理的科学理论就出现了，而它必然会推动新一轮科学革命。
气一元论假设是这样的：无限的宇宙空间中连续着统一的一种物质，它们并不是静止不动的，而是在紧张地相互压迫中存在的，反抗周围物质的压迫是一切存在物的本性，也正是这种本性的存在，局部物质才不断在反抗周围物质的压迫中组织起来，成为一个个暂态的有序结构，我们观察到的一切都是由统一物质组织起来的，只是最初的产生环境不同使它们具有了不同的个性，而看起来空无一物的空间则是统一物质的混沌状态。
显然，在气一元论假设之上，只可能推导出系统论科学，而不可能走向还原论。因为整个世界只有一种物质，还原论在这里根本没有意义，真正的自然规律是一个理，即物质聚散的原理，聚是系统的生，散是系统的亡，所以，自然规律本质上就是物质系统的生死规则，而它才是科学的未来。
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