中国农业科学 | 中国农业科学院油料作物研究所武玉花博士综述农业用植物基因编辑产品检测方法的研究进展
基因组编辑技术是近年来迅速发展的一类遗传修饰技术，可对目标基因进行定点修饰，实现对特定基因片段或少数几个碱基的插入/删除（InDel）和替换。随着基因编辑技术的兴起，基因编辑产品已经从实验室走向产业化应用，2022年农业农村部针对没有引入外源基因的基因编辑植物的安全评价，专门出台了《农业用基因编辑植物安全评价指南（试行）》，2023年为基因编辑大豆AE15-18-1颁发了首个生物安全证书，标志着我国正式开启了基因编辑作物的产业化进程。
基因编辑产品不同于传统转基因产品，不含有外源DNA序列，常用的转基因检测策略不适用于基因编辑产品的检测。随着农作物基因编辑产品产业化进程的积极推进，如何高效准确检测是否为基因编辑产品及其编辑特征，是关系到基因编辑产品产业化利用和知识产权保护的重要依据，急需开发适用于基因编辑产品的检测技术。
近期，中国农业科学院油料作物研究所/农业农村部农业转基因生物溯源重点实验室武玉花博士完成的题为“农业用植物基因编辑产品检测方法研究进展”的综述文章在《中国农业科学》2024年第57卷17期正式发表。
以检测靶标序列是否被编辑为目标，基于PCR、测序等技术开发出了很多检测技术，并广泛应用于产品研发过程中基因编辑产品的筛选。产业化后的安全监管和知识产权保护，不仅要检测样品是否被编辑，还要快速识别待测样品的核苷酸序列特征，确定样品的来源和身份，进而对基因编辑成分进行精准定量，判定是否需要定量标识。
目前，对于含有少数几个碱基插入、缺失及单碱基变异等突变的基因编辑产品，难以应用常规PCR或测序等技术进行快速的身份鉴定，更难以对基因编辑成分的含量进行精准定量检测。
以快速识别编辑后的DNA序列特征、并精准定量为目标，根据基因编辑产品的分子特征，该文综述了基于凝胶电泳的普通PCR法、基于测序的检测方法、基于实时荧光PCR的检测方法、基于数字PCR的检测方法、基于可编程内切酶的方法，以及基于仪器的检测方法在基因编辑产品检测中的应用及优缺点，以期探索出适用于基因编辑产品的检测和定量策略，为后续基因编辑产品检测方法的开发提供参考。
该研究获得科技创新 2030—重大项目（2022ZD0402010）的资助。
论文链接：
引用本文：
武玉花, 翟杉杉, 普豪祯, 高鸿飞, 张华, 李俊, 李允静, 肖芳, 吴刚, 徐利群. 农业用植物基因编辑产品检测方法研究进展[J]. 中国农业科学, 2024, 57(17): 3318-3334.
WU YuHua, ZHAI ShanShan, PU HaoZhen, GAO HongFei, ZHANG Hua, LI Jun, LI YunJing, XIAO Fang, WU Gang, XU LiQun. Progress on Detection Methods for Gene-Edited Organisms[J]. Scientia Agricultura Sinica, 2024, 57(17): 3318-3334.
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