根瘤菌的表型测定，包括对各种碳源、氮源的利用、抗生素抗性、对染料的利用或抗性，对盐、碱的耐受性等^[1]。表型测定曾在根瘤菌数值分类和新种描述中起着重要作用，至今仍是新种描述的必需指标^[2]。由于表型测定的工作繁琐，有时受影响条件较多，重复性不是很好，与基因型研究的结果不一致等，因此，随着根瘤菌基因组测序及比较基因组学的发展，表型的测定以后可能不需要再测了，而是根据基因组的信息去推测根瘤菌有哪些表型特征。基于基因组的分类可能在不久的将来成为提出根瘤菌新种的可靠且通用的方法^[3]。

那么表型测定是不是没有什么用了？我觉得，表型测定可能主要用于根瘤菌突变体表型特征的检测与验证。快速发展BioLog系统，将会对大量的突变体的高通量筛选提供快捷的方法^[4]。

参考文献：

1. http://ijs.sgmjournals.org/content/44/1/151.abstract

2. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Rhizobium+cauense

3.http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0723202013000076

（Ormeño-Orrillo E, Martínez-Romero E. Phenotypic tests in Rhizobium species description: An opinion and (a sympatric speciation) hypothesis. Syst Appl Microbiol. 2013 May;36(3):145-7. doi: 10.1016/j.syapm.2012.11.009. Epub 2013 Feb 13.）

4. http://www.biolog.com/