基因家族聚类软件Orthofinder的报错与解决措施-2022.12.02
2022-12-2 22:47
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● 报错1
● 报错内容:ERROR: external program called by OrthoFinder returned an error code: 1
● 解决措施:
● ①降低orthofinder版本
● ②删除氨基酸序列中的点或把点替换为X,sed -i '/^>/!s/\./X/g' filename.fasta
● 报错2
● 报错内容:IOError: [Errno 2] No such file or directory: '/home/your_path/OrthoFinder/Results_Apr29/WorkingDirectory/Blast4_2.txt'
● 解决措施:检查输入文件的蛋白文件
● 报错3
● 报错内容:nError: Error reading input stream at line 22022: Invalid character (.) in sequence\n'
● 解决措施:删除氨基酸序列中的点或把点替换为X(未知氨基酸),sed -i '/^>/!s/\./X/g' filename.fasta
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