林国鹏
Pan-genome与Core-genome曲线拟合
2021-3-22 21:43
阅读:2704

#“line2P” # y=a*x+b

#“line3P” # y=a*x^2+b*x+c

#“log2P” # y=a*ln(x)+b

#“exp3P” # y=a*exp(b*x)+c

#“power3P” # y=a*x^b+c)

#install.packages("basicTrendline")

#Pan-genome,“power3P”

#Core-genome,"exp3P"

library(basicTrendline)

data1<-read.csv("pan.csv",header = TRUE)

x <- data1$x

y <- data1$y

p1<-trendline(x,y,model="power3P", ePos.x= "top")


data2<-read.csv("Core.csv",header = TRUE)

x <- data2$x

y <- data2$y

p2<-trendline(x,y,model="exp3P", ePos.x= "top")



参考来自:http://blog.sina.com.cn/s/blog_6ac25ea00102yfpc.html





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