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[转载]测序报告中的Q20、Q30代表什么意思?

已有 27698 次阅读 2020-5-11 19:23 |系统分类:科研笔记|文章来源:转载


摘自https://www.cnblogs.com/leezx/p/6265216.html

      二代测序中,每测一个碱基会给出一个相应的质量值,这个质量值是衡量测序准确度的。碱基的质量值13(Q13)代表错误率为5%;Q20代表错误率为1%;Q30代表错误率为0.1%。测序报告中的Q20与Q30则表示质量值≥20或30的碱基所占百分比。例如一共测了1G的数据量,其中有0.9G的碱基质量值大于或等于20,那么Q20就是90%。

        质量值是Q20,则错误识别的概率是1%,即错误率1%,或者正确率是99%;

        质量值是Q30,则错误识别的概率是0.1%,即错误率0.1%,或者正确率是99.9%;

        质量值是Q40,则错误识别的概率是0.01%,即错误率0.01%,或者正确率是99.99%;

        质量值(Q)越高代表碱基被测错的概率(P)越小,其计算公式为Q=-10lgP。例如,Q20和Q30分别代表碱基被测错的概率为1%和1‰。Illumina官方一般以Q30作为评价标准,以目前最常用的HiSeq 2000平台2×100PE测序为例,Illumina官方保证80%以上的碱基准确度达Q30,而千年基因在合同中严格保证85%以上的碱基准确度达Q30。





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