2020年2月22日,瑞士伯尔尼大学病毒与免疫研究所的研究人员在预印本网站biRxiv发表了题为“Rapid reconstruction of SARS-CoV-2 using a synthetic genomicsplatform”的研究论文。
他们开发了一个合成基因组学平台,并利用新冠病毒的核酸序列快速重组出具有活性的病毒。
需要注意的是,这是一项根据已知病毒基因组进行病毒重建的基础研究工作,与“新冠病毒是人工合成的”这样的谣言不是一回事。
(注意:预印本网站bioRxiv的所有论文未经同行评议)
反向遗传学已经成为必不可少的研究工具,它彻底改变了人们对病毒发病机理和疫苗开发的认知。
大型RNA病毒基因组(例如冠状病毒),由于大小和不稳定性,很难在大肠杆菌中克隆和操纵。
因此,开发一个快速而强大的反向遗传学平台用于RNA病毒研究将使学界受益。
研究人员报道了一个基于酵母的合成基因组学平台,其可用于多种RNA病毒的基因重建,包括冠状病毒科、黄病毒科和副粘病毒科家族。
病毒分离物、克隆的病毒DNA、临床样品或合成DNA可用于生成病毒亚基因组片段。
然后,使用转化相关重组(TAR)克隆技术将基因组维持为酵母人工染色体(YAC),从而在酿酒酵母中实现一步重组。
T7-RNA聚合酶被用于产生病毒RNA,进而可以产生活病毒。
基于该平台,研究人员在拿到合成DNA片段后一周内,对最近流行的新冠病毒(SARS-CoV-2)进行了工程改造和复活。
新冠病毒的感染仍在全世界蔓延,病毒在人群中的可能出现序列变异以及疾病表型的改变。
研究人员报道的这一技术可对病毒爆发做出快速响应,从而实时产生不断变化的RNA病毒变体并对其功能进行表征。
论文链接:
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.21.959817v1
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