癌症早期检测对于改善临床结果至关重要,DNA 甲基化生物标志物在癌症早期检测中具有潜力,但传统检测方法需要专业人员和设备,限制了在资源受限地区的应用。期刊ACS Nano在 2024 年第 18 卷第 19 期在线发表《Cancer Methylation Biomarker Detection in an Automated, Portable, Multichannel Magnetofluidic Platform》为题的研究论文,披露了一种癌症筛查装置ACCESS。这是一个小巧便携式、多通道、自动化的平台,可进行液滴磁流体和甲基化特异性 qPCR 检测。自动盒式癌症早期筛查系统(ACCESS)融合了多种技术,实现对癌症甲基化生物标志物的高效检测 ,以下是其构建和工作原理的介绍:
ACCESS 系统的构建
微流控芯片
结构设计: 微流控芯片是系统的核心组件之一,其设计精密,集成了多个微通道和反应室。这些微通道和反应室布局经过精心规划,以确保样品和试剂能够按照预定路径流动和反应。例如,不同功能区域通过微通道相连,实现样品从进样口到各个处理和检测单元的有序输送。
材料选择:通常采用生物相容性良好的材料制作,如聚二甲基硅氧烷(PDMS) 或其他高分子聚合物。这些材料不仅对生物样品无毒性,还具备良好的光学透明性,便于后续的检测步骤中对反应进行观察和分析。
磁场发生装置
磁体布局:围绕微流控芯片设置特定排列的磁体,产生可控的磁场。这些磁体的位置和强度经过精确设计,以实现对磁流体(如结合了目标生物标志物的磁珠)的精准操控。例如,在样品处理阶段,通过调整磁场强度和方向,使磁珠在微通道中按照设定路线移动,实现与其他成分的分离或混合。
磁场控制:配备磁场调节系统,能够根据不同检测需求,精确调整磁场参数。该系统可以实现磁场强度的连续变化以及磁场方向的切换,从而满足从磁珠捕获到分离等一系列操作的要求。
流体驱动系统
泵与阀门: 采用微型泵和微阀门来精确控制流体在微流控芯片中的流动。微型泵负责产生动力,推动样品、试剂以及缓冲液等液体在微通道中移动。例如,注射泵能够精确控制液体的流速和流量,确保反应体系中各成分的准确配比。微阀门则起到开关和分流的作用,可根据程序控制液体的流向,引导其进入不同的反应室或微通道分支。
自动化控制:流体驱动系统与控制系统相连,实现自动化操作。通过预设的程序,系统可以按照特定的时间顺序和流速要求,精确控制各个微型泵和微阀门的工作状态,从而完成复杂的样品处理流程,如多次洗涤、混合等步骤。
检测系统
荧光检测模块: 基于荧光定量 PCR 原理,检测系统配备高灵敏度的荧光检测模块。该模块能够实时监测 PCR 反应过程中荧光信号的变化。例如,在 PCR 扩增过程中,与目标甲基化 DNA 序列特异性结合的荧光探针会释放荧光信号,荧光检测模块通过检测荧光强度的变化,实时反映 DNA 的扩增情况。
数据处理单元:连接荧光检测模块,负责收集、分析和处理检测到的荧光信号数据。数据处理单元内置专业算法,能够将荧光信号强度转换为目标甲基化生物标志物的定量信息,并生成直观的检测报告,显示检测结果。
ACCESS 系统的工作流程
样品准备与进样
磁珠捕获与分离
磁珠结合:在微流控芯片的反应区域内,溶液中的甲基化 DNA 与磁珠表面的探针特异性结合。由于磁珠具有磁性,在磁场发生装置产生的磁场作用下,结合了甲基化 DNA 的磁珠开始向特定方向移动。
分离纯化:通过调整磁场强度和流体流动,将结合有甲基化 DNA 的磁珠与其他杂质分离。例如,未结合的 DNA、蛋白质等杂质随着流体继续流动,而磁珠则被磁场固定在特定位置,然后通过多次洗涤步骤,去除杂质,得到纯化的甲基化 DNA - 磁珠复合物。
洗脱与 PCR 反应
DNA 洗脱:使用特定的洗脱液将甲基化 DNA 从磁珠上洗脱下来,得到纯净的甲基化 DNA 溶液。洗脱后的 DNA 溶液被输送至含有 PCR 反应试剂的反应室。
PCR 扩增:在反应室内,甲基化 DNA 与 PCR 反应试剂(包括引物、dNTP、聚合酶等)混合,进行荧光定量 PCR 反应。PCR 反应在热循环条件下进行,使甲基化 DNA 不断扩增。随着扩增的进行,与目标序列结合的荧光探针会释放荧光信号。
检测与结果分析
荧光信号检测:检测系统中的荧光检测模块实时监测 PCR 反应过程中的荧光信号强度变化。随着甲基化 DNA 的扩增,荧光信号强度逐渐增强,检测模块将这些信号实时采集并传输给数据处理单元。
结果生成:数据处理单元根据荧光信号的变化情况,利用预设算法计算出样品中甲基化生物标志物的含量,并生成检测报告。报告可以直观地显示检测结果,如甲基化 DNA 的拷贝数或相对含量,帮助医生判断患者是否存在癌症相关的甲基化异常。
创新点
技术集成与便携性:将磁流体技术、微流控技术和荧光定量 PCR 技术有机结合,实现了 DNA 甲基化生物标志物的自动化、高通量检测。同时,该平台具有紧凑、便携的特点,可在资源有限的地区或现场进行快速检测。
多通道检测:具备多通道检测功能,可同时对多个甲基化生物标志物进行检测,能够实现对癌症的多靶点诊断,提高诊断的准确性和可靠性。
临床应用潜力:研究聚焦于食管癌,通过对食管癌甲基化生物标志物的成功检测,展示了该平台在食管癌早期检测中的潜力,为食管癌的早期诊断和治疗提供了一种新的方法和工具。
转载本文请联系原作者获取授权,同时请注明本文来自卢长明科学网博客。
链接地址:https://wap.sciencenet.cn/blog-3419762-1469288.html?mobile=1
收藏
分享