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RepeatModel+RepeatMasker 屏蔽重复序列遇到的问题

已有 1102 次阅读 2020-12-18 12:36 |个人分类:数据分析|系统分类:科研笔记

遇到的问题

  1. 运行的时候刚开始报错,我在网上查了一下,大概就是这个连结的问题,但是我实在是不知道怎么进行这种操作,所以就只能卸载了重装,效果明显。
    /home/jungleblack/miniconda3/bin//rmblastn: symbol lookup error: /home/jungleblack/miniconda3/bin/../lib/ncbi-blast+/libmlacli.so: undefined symbol: _ZTVN4ncbi7objects12CMla_requestE

image-20201218112049293

网上找到的解决方法,虽然并没有什么卵用,但确实让我了解到这个问题是啥情况。

  1. 在运行的过程中发现,他只用大肠杆菌的插入单元进行检查
Checking for E. coli insertion elements

我同样在网上找到了别人的疑问:

image-20201218112404264

image-20201218112421122

回答是可以用 -no_is 来跳过这个过程。



https://wap.sciencenet.cn/blog-3412381-1263048.html

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