基于SLAF-seq玉米高密度遗传连锁图谱构建与株型性状QTL定位

薛春雷^1,2，吴慧³，逯晓萍^1*，韩平安²，孙峰成²，张来厚²

1. 内蒙古农业大学农学院，呼和浩特010018

2. 内蒙古自治区农牧业科学院玉米研究所，呼和浩特010031

3. 和林格尔县农业综合开发技术研究评审中心，呼和浩特011500

摘要 株型直接决定生物产量、种植密度与籽粒产量，利用玉米高密度遗传连锁图谱解析株型相关性状的遗传机制，对选育理想株型玉米新品种具有重要意义。本研究利用SLAF-seq技术，依据玉米黄早四参考基因组信息，对昌7-2与PHB1M及其138个F2∶3家系高通量测序，开发高密度SNP的遗传图谱，并进行株型相关性状QTL定位。研究结果构建了一张总图距为1354.81 cM，标记间的平均距离为0.32 cM，标记数为4220个SLAF标签（7876个SNP）的高密度遗传图谱。在E1与E2两种密度下，对株高、穗位、叶片数、节间数、平均节间长进行QTL定位，共检测到10个QTL位点，其中，有7个PVE超过了10%。叶片数、穗位、节间数为主效QTL，ADD为负值，叶片数与节间数的减效等位基因来源于PHB1M，穗位的减效等位基因来源于昌7-2。叶片数与节间数在2个密度下均定位在8号染色体上，说明二者之间有着共同的遗传机制。与QTL关联的SLAF标记共有61个，其中，SLFA7305498和SLFA6717271为qLC-2-LG8与qIC-2-LG8共有标记。该研究将为玉米株型相关性状的标记辅助选择提供支撑。

关键词 玉米；SLAF-seq技术；高通量测序；高密度遗传连锁图谱；株型

（责任编辑  徐丽娇）

http://www.kjdb.org/CN/Y2021/V39/I14/144