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Cell Reports:拟南芥bHLH48/bHLH60和PIF7一起作用于下胚轴伸长的调控

已有 385 次阅读 2021-5-9 16:26 |个人分类:每日摘要|系统分类:论文交流

Two bHLH transcription factors, bHLH48 and bHLH60, associate with phytochrome interacting factor 7 to regulate hypocotyl elongation in Arabidopsis

第一作者Chuanwei Yang

第一单位复旦大学

通讯作者Lin Li


 Abstract 


背景回顾The basic helix-loop-helix (bHLH) transcription factor PHYTOCHROME-INTERACTING FACTOR 7 (PIF7) is a central regulator that promotes stem growth by activating growth-related gene expression during shade-avoidance responses. 


研究意义:Studying the co-factors of PIF7 can facilitate understanding of the mechanism of PIFs and light signal transduction.


主要发现:Here, we describe the identification of two bHLH transcription factors, bHLH48 and bHLH60 (bHLH48/bHLH60), as essential partners for PIF7-dependent modulation of hypocotyl elongationand function downstream of phytochrome B. 


结果1-分子功能:These two bHLH factors display DNA binding activity and interact with PIF7


结果2-遗传分析:Genetic analysis indicated that bHLH48/bHLH60 and PIF7 are interdependent in promoting hypocotyl elongation


结果3-ChIP-seq:Chromatin immunoprecipitation sequencing (ChIP-seq) analysis identified the substantially overlapping downstream targets of bHLH60 and PIF7


结果3-生化分析:Biochemical analysis revealed that bHLH48/bHLH60 enhance the DNA binding ability of PIF7


结论:These results provide evidence that bHLH48/bHLH60 act as positive partners of PIF7 for mutual benefit in the regulation of hypocotyl elongation.


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 摘要 


植物中,bHLH转录因子光敏色素互作因子PIF7是促进茎生长的主要调控因子,其在植物避阴响应中能够激活与生长相关基因的表达。而研究PIF7共因子能够加深我们对于PIFs和光信号转导的认识。本文中,作者鉴定了两个bHLH转录因子,分别是bHLH48bHLH60,这两个转录因子在PIF7依赖型的下胚轴伸长调控和光敏色素B下游功能的发挥都是必不可少的组分。bHLH48/bHLH60均能够结合PIF7,并与之互作。遗传分析显示,bHLH48/bHLH60和PIF7在促进下胚轴伸长方面的功能是相互依赖的。染色质免疫共沉淀测序分析鉴定到了bHLH60和PIF7对于下游靶向区域存在重叠峰。生化实验显示bHLH48/bHLH60能够增强PIF7的DNA结合能力。本文的研究结果揭示了bHLH48/bHLH60作为PIF7的正向“伙伴”蛋白,共同作用于下胚轴伸长的调控。


 通讯作者 

 ** 李琳 **


个人简介:

2001年,山东大学,学士;

2006年,复旦大学,博士;

2007-2012年,美国索克生物研究所,博后。


研究方向

1)避荫反应信号转导途径;

2)光与激素信号转导途径的互作;

3)光调控植物叶片衰老的机制。


doi: https://doi.org/10.1016/j.celrep.2021.109054


Journal: Cell Reports

Published date: May 04, 2021




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