1，STR简介：

STR（Short Tandem Repeat，短串联重复序列）基因位点由长度为3～7个碱基对的短串连重复序列组成 ，这些重复序列广泛存在于人类基因组中，可作为高度多态性标记，被称为细胞的DNA指纹。

2，生产流程：

STR的生产流程主要包括，样本收集，DNA抽提，毛细管凝胶电泳，数据导出和报告分析，其中比较重要的在于实验操作过程中的污染质控，以及后续的报告解读部分。对于需要做申报的公司，运行数据的保存也是相当重要的。

图1,STR整体质控流程

3，鉴定标准和位点：

参考美国国家标准学会(American National Standard Institute,ANSI) 标准：STR Loci (minimum set)TH01, TPOX, vWA, CSF1PO, D16S539, D7S820, D13S317, and D5S818 Gender marker Amelogenin，采用ATCC公布细胞鉴定金标准8位点+1个性别位点，后续11个高度多态性位点辅佐判断。

图2，STR位点信息

4，完整的报告结果：

涵盖一个阳性样本质控峰图结果，数据库比对表，标准的STR鉴定报告，毛细管凝胶电泳测序峰图。其中，阳性质控是比较重要的，能确保实验操作过程中的污染判别，排查实验操作人员或者环境中的污染结果。

图3，完整的STR报告结果

5，质量管理体系：

上海翼和STR严格依据实验室质控标准：ISO9001质量管理体系，CMA司法鉴定标准，建立了完整的质量管理体系，从试剂耗材，到实验操作，数据监控等方面监控实验数据产出，确保数据的真实性及可靠性。

图4，质量管理体系

6，数据库比对：

目前比较常用的数据库包括，美国ATCC细胞库，德国DSMZ细胞库，日本JCRB细胞库，日本Riken细胞库，国家实验细胞资源共享平台，EXPASY数据库结果。翼和实验数据，通过自动检索软件，对比德国DSMZ细胞数据库结果，后续人员复核依照21位点结果，比对EXPASY数据库，国家实验细胞资源共享平台数据作为补充，复查数据结果。

图5，数据库比对结果

7，判读标准:

匹配度(EV值)计算公式：=匹配度（%）

EV值≥1.0，细胞完全匹配参考细胞结果。

0.8≤EV值＜1.0，细胞基本匹配参考细胞结果，基本匹配往往伴随多等位的结果，需要参考21位点的结果来判读是否是交叉污染，还是细胞微卫星不稳定导致的。

EV值＜0.8，细胞不匹配。

8，增值服务：

(1) 基于QPCR方法的4种属鉴定结果，往往是人和小鼠STR鉴定体系检测不到信号值的情况下，免费帮客户补测种属。确保种属来源正确，或者排查其他种属源细胞污染的情况。4种属涵盖：人，小鼠，大鼠，仓鼠，4个物种。

(2) 10种属鉴定结果:QPCR原理的种属检测服务，后续根据客户意愿决定是否需要排查4种属外的其他物种结果。

(3) 英文报告：部分公司或者科研单位，尤其发表论文的老师，需要提供报告的英文报告用于发表论文。可以联系对应销售人员安排免费出具英文报告结果。

(4) 为期至少一年的数据保留，和半年的客户样本保留。

9，STR应用场景：

（1）常见永生化细胞的鉴定，论文发表和公司细胞库建库。

（2）细胞培养过程中的交叉污染情况排查。

（3）干细胞来源一致性比对。

（4）自主的原代细胞建立，排查污染和原始数据保留。

10，参考文献：

1，A resource for cell line authentication, annotation and quality control Nature 520,307–311(16 April 2015)

2，Cell line misidentification：the beginning of the end Nature Reviews Cancer 10, (June 2010)

3，American Type Culture Collection Standards Development Organization Workgroup,A.S.N., Cell line misidentification: the beginning of the end. Nat Rev Cancer, 2010. 10(6):p. 441-8.

4，Reid Y, Storts D, Riss T, Minor L. Authentication of Human Cell Lines by STR DNA Profiling Analysis. Assay Guidance Manual [Internet]. Bethesda (MD): Eli Lilly & Company and the National Center for Advancing Translational Sciences; 2004-.2013 May 1.