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生物系统的方法论 - 细胞逻辑与人工细胞

已有 1900 次阅读 2015-10-16 11:55 |个人分类:系统生物学|系统分类:科普集锦| 系统医学, 系统药物学

任何一个有限点,通往无限时空。
看过万花筒和分维几何,就能明白这一点;但是,加上单位的限制,如,分子大小,有限空间就只能容纳一定类型分子的有限数量,数学抽象,往往是在这个物理的单位上抽掉了。

B.Mardelbrot和BJ.Zeng都对DW.Thompson的《生长与形态》感兴趣。在BJ.Zeng的《结构论》参考文献,不仅引用了DW.Thompson和B.Mardelbrot的文献,而且,贝塔朗菲的《一般系统论》和R.Rosen的理论生物学论文等,1999年建立biosystem network而在2001年的网页,也列出了T.Pawson、E.Hafen和E.Kool等相关文献。

生物系统结构论的1991-1997年系列文章探索与思考,涉及到诺依曼的计算机模型和图灵的形态发生理论,构成系统与合成生物学的理论基础,包括,振荡现象的鲁棒性(robustness)和细胞通讯的分子电路等经典的人工生物系统设计原理与方法。

1992年BJ.Zeng提出系统医学与药物学概念和模型;然而,1910年法国S.Leduc、1974年波兰W.Szybaski和1980年德国Hobom等论述的合成生物学是化学合成与基因重组概念,1968年美国M.Mesarovic、1993年德国W.Zieglgansberger和TR.Tolle等阐述的系统生物学是理论生物学概念,而生态学、生理学与生物化学,包括,D.Nobel的心脏起搏数学模型,以及1992年日本T.Kamada的系统生物医学等,仍然是生态系统和器官系统的研究。

20世纪90年代,生物系统的科学与工程,从生态、生理和生物化学深入到细胞和分子生物系统的整合、稳态与建构的理论和实验、计算与工程方法,尤其图论与网络拓扑学分析、生物电子学设计原理等。2007年BJ.Zeng论述第3次工业革命,而到2012年美国J.里夫金出版专著,经历了1992-2012年的结构论 - 精神论与机器论探讨时间。

数学的无穷,在物理学的宇宙弦论、生物学的遗传进化和心理学的格式塔转换,以及社会学的城市网络等领域,又展现出了信息传输的无限时空。

- (2011-2015网络日记,从乔布斯院士到屠呦呦诺贝尔奖) -



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