- 纲领

V1.0系统生物学（1968年D.Mesarovic）– 系统论与数学方法的生物学研究。

V2.0系统生物科学与工程（1994-1999年BJ.Zeng）– 理论与实验、计算与工程方法的生物系统与人工生物系统研究。

1999-2001年开始：

1）理论与数学方法 – 系统理论、数学模型等，

比如，DB.Kell、O.Wolkenhauer等；

2）计算与拓扑网络 – 计算机模拟、网络科学等，

比如，N.Nobel、A-L.Barabási等；

3）组学与芯片实验 – 分子表达谱、数据分析等，

比如，L.Hood、R.Aebersold等；

4）纳米与工程设计 – 基因合成、模块设计等，

比如，E.Kool、AP.Arkin等。

V3.0系统遗传学与医药学（1992-1994年BJ.Zeng）– 生物系统论和系统分析与综合。

2003-2007年开始：

1）“基因型-表达型”复杂系统 – 分子网络、细胞周期和动力学，

比如，S.Leibler、B.Palsson、van Oudenaarden、R.Linding、M.Kirschner等；

2）生物计算机和细胞工厂 – 基因回路、信号传导和代谢网络等系统设计与人工合成，

比如，

代谢工程 - J.Nielsen、J.Keasling，

细胞计算机 - T.Knight、D.Endy*，

基因合成与建构 - G.Church、HO.Smith，

分子调控模块 - J.Collins、C.Voigt等。

其中，

V1.0和V2.0-1)系统科学理论基础，包括，控制论、信息论和耗散结构论、超循环论、混沌理论和非线性动力学等；

V3.0为生物系统的机理和设计，

揭示进化-发育和病理发生机理，筛选药物和生物制药，开发生物能源、传感器和反应器等人工生物系统。

注*：

论述合成生物学，转换成了系统生物学的遗传工程概念。

-（工程医学-生物系统设计）-