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21世纪国际上才正式发表系统生物学的研究论文,1968年D.Mesarovic在系统论与生物学会议论文集中提出“systems biology”词汇,但未见后续发展,词汇也就再次见于W.Zieglgansberger和TR.Tolle于1993年发表的神经科学论文摘要中。 影响我的系统分层建构观点,也是1970年R.Rosen发表在理论生物学杂志上的数学生物学论文,并未从读到他参与编辑的1968年会议论文集,而我自1991年至1995年论述的基本是概念、原理和方法等。 2001年与胡德院士一同发表系统生物学的组学(omics为胡德所造)方法论文是T.Ideker,尽管O.Wolkenhauer于6月已经递交论文提及D.Mesarovic的术语,却都是9月公开发表。T.Ideker有MIT的经历,加入胡德的实验室,存在一定必然,论述组学和实验数据的系统(systematic)测量。 尽管1999年G.Church已发表蛋白质相互作用的芯片实验和系统(systematic)分析等,而蛋白质组(proteome)是1994年M..Wilkins在“2D Electrophoresis”会议上提出。组学(omics)方法,可说起于氨基酸2D层析和Northern、Southern和Western等杂交实验,T.Ideker论述了1992年P.Liang等发表的mRNA差异显示技术为表达谱分析的起点。 胡德、北野宏明的论文引用了JJ.Collins和S.Leibler的文献,基因调控和代谢系统的稳态现象是分子层面的系统生物学切入点。如同,我的论述以乳糖操纵子模型为系统生物学与分子生物学的衔接点,而对中医药理论和艾根超循环理论的诠释是器官代谢系统、分子信息调控系统的稳态模型和拓扑学方法。 胡德、G.Church贡献的都是基因合成、测序和芯片等领域的技术发明和开拓。同时,G.Church又称合成生物学为建构(constructive)生物学,之所以欣赏是因为结构论第3条规律是分层建构的组织规律,如同组合家具、组装建筑和集成电路的建构,分层次和模块设计是R.Rosen分层理论的逻辑延伸。 1999年S.Leibler发表模块(modular)生物学论文,当时就引起我的兴趣,并于2001年文献表中也列入1995年T.Pawson的蛋白质模块论文,T.Knight提出Bio-brick也属于同一个类型的概念,而2013年T.Ideker也论述了整合方法的生物网络模块结构研究等。 系统(systematic)实验和数据整合分析,与同系统理论、系统方法(approaches)生物系统设计等构成系统生物学概念基础,包括,C.Nuslein-Volhard的基因突变实验、S.Brenner的基因相互作用研究等。 人物(2) - G.Church - http://en.wikipedia.org/wiki/George_M._Church; - http://arep.med.harvard.edu/gmc/; 和他的婚姻 - http://genetics.med.harvard.edu/faculty/twu。 -(系统生物学人物)-
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