系统与合成生物学，揭示生物系统机理与设计人工生物系统的科学与工程偶合研究，20世纪90年代BjZeng开始于系统与合成这两个概念，核心方法是图论与网络拓扑学分析、太阳能-生物电子学设计原理和计算机软件模拟、进化与发育的基因调控表达谱 - 细胞分子层面的生物系统网络等。

纳米生物化学机器，从人工合成生物分子和基因重组技术，到细胞纳米机器的生物系统工程，信息与通信技术的编码、程序与传输、释义及其编程、系统设计与建构或组织化与装配的概念的应用 - 1910年法国和1974年波兰的合成生物学概念转换到1994年中国的系统生物工程概念和体系。

简单说，系统与合成生物学是视生物体为有机体机器的观念，进行生物系统的机理分析与工程原理设计，生物信息学发展到计算生物学和分子生物学发展到组学生物学，而系统生物学的实验技术和计算机方法，则是采用仪器和软件来研究生物体。

一个学科不仅是词汇，尤其是概念和方法及其原理等作为一个体系的范式提出，才是一个学科建立的关键内容，分辨90年代之后的系统生物学和合成生物学范式与方法，并不同于之前词汇的概念定义与描述。

即，理论生物学的系统生物学与DNA分子重组的合成生物学转换到生物系统的科学与工程（BSSE）的偶合模式–1996年在国际上阐述生物系统理论与系统生物工程，到1999年倡导计算生物学与实验生物学结合的天然与人工生物系统研究等。

1999年到2003年系统与合成生物学学术共同体和系统理论与实验技术、计算机模拟与工程设计方法的学派形成，2003年到2007年系统生物科学与工程的体系建立，2007年瑞士ETH成立D-BSSE系统与合成生物学研究中心，也就进入了常规科学时期。

一个新学科的创建时期，实际上是哲学到科学的转换和传统学科转换到新的领域，以及交叉其它学科和综合其它技术的一个过程，中医药理论自成体系– 即，学术范式和医疗模式，具有自洽的完备性，突破就往往就会是新的学科体系了，也就是说系统医学是系统与合成生物学的应用和偶合模式。

附、系统医学的结构论原理

1983-1993年结构论，2003-2014年4世界与4轴心时代理论，包括，系统医学、城市群和道德经济学等理论，以及李约瑟-钱学森问题的探讨。

1992-1994年

系统医药学 - 系统遗传学与系统生物工程，系统与综合哲学的结构论原理 - 图论与网络拓扑分析方法，系统科学与人工智能、基因工程 - 太阳能-生物电子技术设计，发育的基因与神经双向调控的细胞分子生物系统模型，转基因禽类生物反应器和细胞仿生工程。

1996-1999年

组织国际会议与筹备国际协会，建立生物系统科学与工程的biosystem network网站，阐述系统、计算机、纳米与生物科学的交叉，实证分析与系统综合的生物系统理论，系统生物工程 - 计算生物学、生物信息技术与计算机辅助设计，实验生物学、分子生物技术与表达谱分析，耐药细胞系的连续突变与筛选方法。

1999-2003年

仿生学与转基因技术 - 细胞通讯的分子电路设计，细胞发生动力学与自动化细胞模块设计 - 细胞通讯的信号传导、基因调控与代谢网络和进化-发育的系统遗传学。

2008-2012年

成立系统生物工程研究所ltd.，开发细胞分析与合成芯片技术 - 序列标志片段显示分析，细胞纳米机器设计与原则，阐述纳米、信息、电子与生物（Nieb）技术、第4次科学与技术革命和生物工业革命等。

-（1996年-2016年20周年纪念，BjZeng）-