生物体发育与基因组进化的生物学研究，从进化论到系统论，而到结构论，就是从基因突变与生态适应理论到非线性细胞发生动力学的理论发展。

系统生物学的建立，经历了几个方面的转换过程：

1）  系统科学理论与数学生物学，转换到生物系统理论与网络拓扑学；

2）  生物分子的化学合成与基因重组技术，转换到生物电子学与生物工程设计；

3）  生物信息技术，转换到计算生物学与计算机软件模拟；

4）  分子生物技术，转换到纳米生物学与实验生物技术；

5）  生态系统和器官系统、代谢系统，深入到细胞分子生物系统；

6）  系统理论生物学与化学合成生物学，转换到生物系统的科学与工程等。

其中，系统医学是建立在实证科学基础上的循证、整合与工程医学，以及系统分析与综合方法和转化与个体化、精准医学模式，既不同于传统中医学，也不同于实验分子医学，而是系统与合成生物学的应用。