#! /bin/bash

#download https://github.com/billzt/readfq
#purpose: calculate reads from fastq files
#set env
readfq="/home/zhanghl/supporting_softwares/readfq/readfq-master/kseq_fastq_base"
fq_dir=""
cd $fq_dir  #fq所在位置
ls *.fq.gz > fq.list #collect fastq files
for i in $(cat fq.list)
do 
  printf $i "\t" >> fq.reads_num
  $readfq $i     >> fq.reads_num
done