成人首患急性髓细胞性白血病的基因组学和表观遗传组学图谱

BACKGROUND

促进急性髓性白血病（AML）发生的许多突变尚不明确，对突变模式和表观遗传表型的关系尚不清楚。

METHODS

我们分析了200个有临床注释的首次患AML的成人病例的基因图谱，包括50例全基因组测序、150例全外显子组的测序，以及RNA和微小RNA测序和DNA甲基化分析。

RESULTS

AML基因组比其它大多数类型的成人癌症存在更少突变，平均只有13个突变基因。在这些基因中，平均有5个基因在AML中发生周而复始的突变。总共23个基因有显著突变，其它237个基因在两三个病例中有突变。在基本确定与AML发生有关的九类基因中，包括转录因子融合（18%病例）、核仁磷酸蛋白编码基因（NPM1）（27%），肿瘤抑制因子基因（16%）、DNA甲基化相关基因（44%）、信号基因（59%）、染色质修饰基因（30%）、骨髓转录因子基因（22%）、黏连蛋白复合体基因（13%）和剪接体复合体基因（14%），几乎所有的病例会在其中一类中存在至少1个非同义突变。这种协作而又相互排斥的作用模式，揭示了几个基因和不同分类之间强大的生物学联系。

CONCLUSIONS

在几乎所有的AML样本中，我们鉴定出了至少一种潜在的驱动突变，在个别病例中发现了促进AML发生的遗传活动的复杂相互作用。作为进一步研究AML的发病机理、分类和风险评估的基础，该项研究的数据库可供广泛使用。