不积小流 , 无以成江海 !分享 http://blog.sciencenet.cn/u/xiongchaoliang

博文

lncRNA研究相关数据库

已有 5166 次阅读 2016-4-24 11:51 |个人分类:【数据库】|系统分类:科研笔记

lncRNA近几年是研究的热点之热点,凡各种基金、项目申报都会想法设法跟这个大神扯点关系。本文来聊一聊现在热门的几个lncRNA相关的数据库:

1). lncRNAdb: 提供有生物学功能的长链非编码RNA的全面注释。这是长链非编码RNA研究领域的著名数据库。

网址:http://www.lncrnadb.org/

2). NONCODE: 提供对长链非编码RNA的全面注释,包括表达以及该团队开发的ncFANs计算软件预测的lncRNA功能。非编码RNA研究的知名数据库。

网址: http://www.noncode.org

3). LNCipedia: 对人类的长链非编码RNA的序列和结构全面的注释。

网址:http://www.lncipedia.org

4). LncRNADisease: 提供了文献报道的疾病相关的长链非编码RNA的注释。

网址: http://cmbi.bjmu.edu.cn/lncrnadisease

5). NRED: 提供人和小鼠的长链非编码RNA在芯片数据的表达信息。

网址:http://jsm-research.imb.uq.edu.au/nred/

6). ChIPBase: 提供长链非编码RNA的表达图谱和转录调控的全面鉴定和注释。整合了高通量的RNA-seq鉴定的lncRNA及其表达图谱和ChIP-Seq实验技术鉴定的转录因子结合位点。

网址:http://deepbase.sysu.edu.cn/chipbase/

7) fRNAdb: 收集了包括H-invNONCODE RNAdb 三个数据库的注释和未注释的非编码转录本。

8) 网址:http://www.ncrna.org/frnadb/

小编推荐网站:http://www.lncrnablog.com/,该网站包含lncRNA研究动态、各种分析工具和数据库。



https://wap.sciencenet.cn/blog-1509670-972365.html

上一篇:用R语言画条形图
下一篇:Hi,PPTer----PPT资源导航
收藏 IP: 159.226.43.*| 热度|

0

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (0 个评论)

数据加载中...

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-4-19 10:38

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部