熊朝亮
ctcRbase:循环肿瘤细胞/微栓子数据库
2020-5-28 16:26
阅读:4691

ctcRbase:
http://www.origin-gene.cn/database/ctcRbase/index.html
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循环肿瘤细胞/微栓子(CTCs / CTM)是指从癌性病变中脱离并脱落到血液中的肿瘤细胞。CTCs / CTM分析可以实现对晚期癌症的非侵入性监测,以及肿瘤转移的早期检测。通过无创液体活检分析CTCs / CTM来研究癌细胞生物标志物的表达,已成为癌症研究中最热门的领域之一。
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2020年5月15日华东师范大学生科院发布的ctcRbase数据库,收集了来自TCGA、GEO各种肿瘤类型CTC和CTM的转录组表达数据。ctcRbase总共收集了526个肿瘤样本,14631个mRNA和3642个lncRNA的表达信息。ctcRbase还提供原发性肿瘤和白细胞(WBC)的表达数据。构建了一个易于使用的界面来查询和浏览CTC / CTM中的基因表达。

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