通过阴道微生物转移部分恢复剖宫产婴儿的微生物群
分娩方式是新生儿微生物群组成的主要决定因素。阴道分娩的婴儿体内的细菌群落与母体阴道相似，而剖腹产婴儿体内的皮肤微生物群丰富。定植于新生儿体内的微生物群在培养免疫系统方面起着决定性的作用。与共生微生物的早期相互作用对健康的免疫发育和代谢规划至关重要，新生儿体内异常的微生物定植与宿主代谢的长期影响或免疫发育受损有关。流行病学研究虽然没有显示因果关系，但报道了剖腹产与肥胖、哮喘、过敏和免疫缺陷风险增加之间的关系。全世界的剖宫产率正在增加，在一些国家，剖宫产率超过了总出生率的50%，大大超过了为保护母亲或婴儿的健康而需要剖腹产的估计出生率的15%。
2016年3月的《自然·医学》发表了美国纽约大学医学院、波多黎各大学生物系、纽约西奈山伊坎医学院遗传学和基因组科学系、加州大学圣地亚哥分校儿科、科罗拉多大学生态与进化生物学系、纽约大学坦顿工程学院、波多黎各大学医学院妇产科系、加州大学圣地亚哥分校计算机科学与工程系和纽约西奈山伊坎医学院临床免疫学系医学部多家研究机构的研究人员的“通过阴道微生物转移部分恢复剖宫产婴儿的微生物群”的文章。文章报道新生儿暴露于母体阴道微生物群会因剖宫产而中断。剖宫产（C-section）分娩的婴儿获得了不同于阴道分娩婴儿的微生物群，并且C-section分娩与免疫和代谢紊乱的风险增加有关。他们进行了一项初步研究，其中剖宫产的婴儿在出生时暴露于母体阴道液中。
在他们进行的这项研究中，剖腹产婴儿在出生时暴露于母体阴道液中，并纵向测定其微生物群的组成，以评估他们是否比未暴露于阴道的剖腹产婴儿发育得更相似。他们总共收集了18名婴儿及其母亲的样本，包括7名阴道分娩的婴儿和11名计划剖腹产的婴儿，其中4名婴儿在出生时暴露于母体阴道液中。微生物修复程序包括在剖腹产前一小时内，在B组链球菌（GBS）阴性、无阴道病迹象、阴道pH值低于4.5的母亲的阴道中培养无菌纱布。在婴儿出生后的头两分钟内，用纱布往婴儿擦拭母亲阴道内容物，从嘴开始，然后是脸，最后是身体的其他部分。在婴儿出生后1个月（出生后1、3、7、14、21和30天）的6个时间点，从婴儿和母亲的肛门、口腔和皮肤部位采集了1519份样本，通过对16S rRNA基因V4区进行测序来表征微生物组组成，并在质量过滤后利用1016个样品进行分析。结果表明涂抹了母亲阴道分泌物的剖宫产的新生儿的肠道菌群类似于阴道分娩的婴儿。这些新生儿在出生后30天内的口腔和皮肤细菌群落富含阴道细菌，而阴道细菌在未暴露的剖宫产婴儿中的代表性不足，口腔和皮肤样本中的微生物组与阴道产婴儿的相似性大于肛门样本。虽然恢复剖宫产婴儿的微生物群的长期健康后果尚不清楚，但他们的研究结果表明，剖宫产婴儿的阴道微生物在出生时可以部分恢复。
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