ProteinGod的个人博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/ProteinGod 风云变幻无动于形,惊涛骇浪无动于色,成败付之一笑,生死只做天命尔。 然有生之年必为大器,死时亦如雷波惊变,呼啸于世

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Cryo-EM 初学者入门资料集锦(一)

已有 20798 次阅读 2017-7-12 02:49 |个人分类:冷冻电镜(CryoEM)|系统分类:论文交流| 结构生物学, 冷冻电镜, cryo-EM, 生物电镜

本文由清华大学 宋文飞整理

原文链接:

Cryo-EM 初学者入门资料集锦(一)


书籍:


冷冻电镜相关书籍:

Three-Dimensional Electron Microscopy of Macromolecular Assemblies

by Joachim Frank


冷冻电镜基本原理书籍:

Diffraction PhysicsThird Revised Edition by John M.Cowley


《电子衍射物理教程》 by 王蓉


《电子晶体学与图像处理》by 李方华


《薄晶体电子显微学》by P. Hirsch


视频:


冷冻电子显微镜(Cryo-EM)入门by 加州理工学院 Grant J.Jensen

链接https://www.coursera.org/learn/cryo-em


Eva Nogales 的视频:

链接https://www.youtube.com/watch?v=nkGRhYv01ag


MRC Lectures:

链接ftp://ftp.mrc-lmb.cam.ac.uk/pub/scheres/EM-course


NRAMM Workshops:

链接http://nramm.nysbc.org/workshops/


NRAMM videos:

链接https://www.youtube.com/channel/UCgd1dW4HQ_yvpRjFc670htw


CCPEM symposium:

接:https://sas.stfc.ac.uk/vportal/


Advances in Cryo-EM related books


Cryo-EM Part A-C & Recent advances in cryo-EM (Methods in Enzymology)

链接http://www.sciencedirect.com/science/bookseries/00766879/481

          http://www.sciencedirect.com/science/bookseries/00766879/482

          http://www.sciencedirect.com/science/bookseries/00766879/483

          http://www.sciencedirect.com/science/bookseries/00766879/579


Reviews of Cryo-EM


"A primer to single-particle cryo-electron microscopy."

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25910204

"Structural analysis of macromolecular assemblies by electron microscopy." https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21919528

Structural Analysis of Protein Complexes by Cryo Electron Microscopy

https://link.springer.com/protocol/10.1007%2F978-1-4939-7033-9_28

电子显微三维重构技术发展与前沿

http://www.cnki.com.cn/Article/CJFDTotal-SWWL201007005.htm


论坛:


http://www.bio3dem.com/


数据库:


http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do

http://www.ebi.ac.uk/pdbe/emdb/index.html/

http://www.emdatabank.org


软件:


常用计算相关软件:

Relion:

http://www2.mrc-lmb.cam.ac.uk/relion

Eman:

http://blake.bcm.edu/emanwiki/EMAN2

Gctf / Gautomatch:

http://www.mrc-lmb.cam.ac.uk/kzhang

Frealign:

http://emlab.rose2.brandeis.edu/frealign

数据收集、后处理等更多相关软件汇总网址:

http://www.emdatabank.org/emsoftware.html

https://en.wikibooks.org/wiki/Software_Tools_For_Molecular_Microscopy


致谢:

BioDEM 论坛Ming、Jyfhat123为本文提供了资料,Bio3DEM 张凯(MRC-LMB)对本文撰写和校对等提出宝贵意见,特此致谢!


往期文章:

Bio3DEM公号和论坛介绍

如何解决取向优势?

(临时logo,Bio3DEM正式logo继续征集中)

冷冻电镜(cryo-EM)相关链接:

冷冻电镜cryo-EM专业公号Bio3DEM开通

冷冻电镜cryo-EM,三维生物电镜Bio3DEM论坛

冷冻电镜cryoEM知乎专栏




https://wap.sciencenet.cn/blog-972184-1065823.html

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