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2020-2-24 22:24
我的新博客主要用于 分享药物设计软件的使用技巧 和 一些 编程知识。 欢迎大家 访问我的 新博客 , 和我互动交流。 http://blog.chenzhaoqiang.com/
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win32::GUI的简单认识
2014-12-3 16:43
代码的框架: 一个main函数实现界面的布局, 子函数变成pm文件, ################################################## win32::gui的评价 使用起来非常简单, 如果可选项中没有的功能,实现起来就比较复杂。 运行的时候会有各种bug出现要不停的修复,好烦的。 也可能是第一次写GUI。 ##################### ...
个人分类: DrugDesign|6489 次阅读|没有评论
化合物CAS号码的认识
热度 2 2014-11-28 16:59
一个化合物目前只有1个cas号,但是曾经可能使用过其它的cas号, ## 化合物 C6 H14 O6 D-Mannitol 目前使用的cas号是 69-65-8 曾经使用过( 75398-80-0 85085-15-0 123897-58-5) Molecular Weight 182.17 pKa (Predicted) Value: 13.14±0.20 | Condition: Most Aci ...
5770 次阅读|7 个评论 热度 2
怎么查看文件的编码
2014-11-26 20:31
有些文件里面的内容是一样的, 在处理过程中会不一样。 这时可以考虑cat -A 看不可见字符 然后再考虑看看他们的编码是否一致。 方法: 用记事本打开文件;然后另存为
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pymol提取pdb小分子的注意事项
2014-11-23 18:28
在pymol中打开晶体复合物, 然后选中小分子,file---》save molecule--》sele--》ligand.pdb 用文本打开发现里面是有connect的信息的, 仔细一看,会发现这些connect是错误的,出现好多4键的情况。 但是在pymol中可以正常显示这些分子中的苯环,set valence,1 pymol可能会自动添加键的信息。 在maestro中 ...
个人分类: DrugDesign|13129 次阅读|没有评论
schrodinger中N原子的手性
热度 2 2014-11-18 14:14
###########网络中的材料################## sp3的N不算那个孤对电子是三角锥结构的,但三个基团在室温下就很容易伞转,一般也不认为是手性 sp2的N是平面的,没有手性 三级胺中因为N上有一个孤对电子,所以可以认为N连接的四个基团不同,所以具有手性,但是因为孤对电子的位阻较小,所以N上连接的另外三个基团可以 ...
个人分类: 大数据|12882 次阅读|3 个评论 热度 2
化合物的手性如何存储在文本中
热度 2 2014-11-13 16:54
在谈化合物的手性的时候, 先谈谈chirality和parity的区别 chirality是化学中所说的手性 parity翻译为宇称,新规则下的手性 Parity is a general type of specification of chirality. 计算机中对手性原子的重新定义。 parity和chirality都和顺时针逆时针有关 顺时针parity的值为1,逆时针值为2,非手性碳为0,手性 ...
个人分类: DrugDesign|4558 次阅读|11 个评论 热度 2

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