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CFEA:游离DNA表观遗传修饰(5mC、5hmC、核小体定位)数据库

已有 4088 次阅读 2019-8-31 17:06 |个人分类:网站|系统分类:科研笔记| cfDNA, 5mC, 5hmC, 核小体定位, 数据库

cfDNA是疾病液体活检的一种强大工具,而cfDNA的表观遗传修饰对于疾病检测和分类也是至关重要的。

作者使用公共数据库数据,开发了标准化质控、分析流程,并构建了一个网络服务器,以在基因组规模上查询、可视化5mC、5hmC和核小体定位信息。

使用该数据库,用户能够:

1,浏览来自血浆或血清的cfDNA的表观遗传信息

2,浏览癌症发展不同阶段(早期、晚期或转移期)的cfDNA表观基因组

3,USCS基因组可视化和比较

4,下载数据

5,使用CFEA流程分析公共或私有cfDNA表观基因组数据。


流程如下:

reference.png



参考文献:CFEA: a cell-free epigenome atlas in human diseases



https://wap.sciencenet.cn/blog-707141-1196054.html

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