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置顶 · bioconda中国镜像(清华,中科大腾讯源均已失效)
隐藏 2017-9-21 13:04
bioconda是conda上一个分发生物信息软件的频道,现在已经有超过2700款软件。由于国内没有基镜像,下载安装生物信息软件速度十分缓慢,经常中断,生物信息人迫切需要一个国内镜像。Bioconda is a channel for the conda package manager specializing in bioinformatics software。 201 ...
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有向后不兼容接口更改,QIIME 2 2024.2 来啦
2024-2-23 11:57
今年 12 月,QIIME 2 团队选择放弃计划的 2023.11 版本,转而减少拉取请求的长队列并开发一些新功能。 有关 2024.2 中计划中的 向后不兼容接口更改 的完整详细信息,以及最新的环境文件可以在此处找到! QIIME 2 2024.2 版本现已发布!感谢所有参与者的辛勤工作! 提醒一下,我们计划的下一个 QIIME 2 版本计划于 ...
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Greengenes2 2022.10
2023-3-14 09:24
没错,你没看错,十年后最经典的16S数据库--Greengenes数据库更新了,提供了Qiime2兼容插件,分析流程,还将继续更新,用起来呀!虽然还没发表,只是上传在了预印本服务器,相信肯定会发Nature啦! 先来欣赏上NCS级别的酷图,是不是感觉帅呆了! ! (https://github.com/biocore/q2-greengenes2/).该插件提供了将数据与资 ...
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QIIME 2 2022.8 来啦
2022-8-30 15:08
有多少小伙伴和我一样,一直期盼着Qiime2更新的,在月末,qiime2新版本终于发布啦! 小编黑板: 1.Galaxy版本22.05中得到正式支持,同时q2studio被弃用(放弃造轮子啦!) 2.从BLAST6Format搜索结果生成共识注释 3.大大加快了样本数据拆分的速度 4.社区开发版提供了分析粪便微生物群移植的新功能 5.改进了A ...
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qiime2-2022.2发布啦
2022-3-24 08:48
本现已发布!感谢所有参与者的辛勤工作! 提醒一下,我们计划的下一个QIIME 2版本计划于2022年4月发布(QIIME 2 2022.4),请继续关注更新。 查看 QIIME 2 2022.2 文档 有关安装最新QIIME 2版本以及教程和其他资源的详细信息。如果您遇到任何问题,请在QIIME 2论坛上与我们联系! 虚拟机构建版本已经推出(q2galaxy 除 ...
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QIIME 2 2021.11发布啦
2021-11-28 10:37
QIIME 2 2021.11 版本现已推出!感谢所有参与者的辛勤工作! 下一版计划于 2021 年2月(QIIME 2 2022.2)发布,请继续关注更新。 查看 QIIME 2 2021.11 文档 f有关安装最新 QIIME 2 版本的详细信息,以及教程和其他资源。如果您遇到任何问题,请联系 QIIME 2 论坛! 虚拟机生成将在下周的某个时候提供, ...
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snpQT-又一个人基因组SNP填充和GWAS流程
2021-9-12 12:28
发现搜索引擎是个神奇的东西,偶然想起的关键词一搜索,获得的就是意想不到的结果,我以imputation+qc搜索,就找到了snpQT(发音Snip Cute)这样一个神奇的工具/流程。 这个流程的目的是让你的SNP cute,为处理人类基因变异提供了帮助: 基因组版本转换(b37-b38或者反过来) 样本质控 人群分层 填充 ...
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QIIME 2 2021.8到来啦
2021-9-12 12:27
QIIME 2 2021.8 版本现已推出!感谢所有参与的辛勤工作! 下一版计划于 2021 年 810月(QIIME 2 2021.10)发布,请继续关注更新。 看看 QIIME 2 2021.8 文档 有关安装最新 QIIME 2 版本的详细信息,以及教程和其他资源。如果您遇到任何问题,请联系 QIIME 2 论坛! 虚拟机生成将在下周的某个时候提供,关注论坛的更新! ...
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《高效R语言编程》笔记汇总
2021-8-1 20:49
1.《高效R语言编程》笔记 2. 高效R编程 3. 高效使用R笔记3 4. 《高效R语言编程》4-高效工作流 5. 《高效R语言编程》5-高效输入输出 6. 《高效R语言编程》6--高效数据木匠 7. 《高效R语言编程》7--高效优化 8. 《高效R语言编程》8--高效硬件 9. ...
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新技能Get!宏基因组分析结果导入qiime2分析和可视化
2021-5-18 08:32
最近读微生态公众号中宏基因组的文章,发现阿童木写的教程,宏基因组的数据可以导入qiime2分析。于是有了发现新大陆的感觉,qiime2是一个优秀的可视化工具,有它在手,分析不愁呀,可是作者并没有给出怎样导入数据的教程,我摸索了一番,基本解决了问题,欢迎交流呀! 数据是使用biobakery的流程得到的metaphlan3的结果 ...
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高效R编程
2021-4-25 16:43
这是《高效R语言编程》的学习笔记,前面的笔记在这里: https://blog.csdn.net/zd200572/article/details/115349366 https://www.jianshu.com/p/71392ef45d01 很多R语言用户并不认为自己是程序员,我也是:),精通专业知识,理解R语言的标准数据结构,但是缺乏正规编程训练,你是这样的吗? 高效编程的5个技 ...
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GMT+8, 2024-3-29 03:39

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