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菊科数据库GCD(Global Compositae Database)简介

已有 3556 次阅读 2020-11-8 16:06 |个人分类:文献|系统分类:科研笔记

最近看Taxon期刊上最新一期的文章时,发现有一个介绍菊科数据库的短文:

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全文链接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/tax.12326


文中有张“菊科工作组”的一张合影,只有一个中国人,是指导我博士论文的主要导师。他参与了这个数据库的工作,应该是提供及审核是中国的菊科名录及分布信息,以及他所研究的一些类群。


全球菊科植物数据库的网址:https://www.compositae.org/gcd.php

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这个数据库的前身是“全球菊科植物名录”(GCC),在TPL数据库(http://theplantlist.org/)首页上还有老数据库的logo和链接(现已自动转到新版数据库网址)

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这个菊科统计一览表,使用的分类系统是叶绿体的13个亚科分类系统。这3大亚科的种数比大多数科的种数还要多。对了,发现表格竟然漏了第四大亚科Mutisioideae(有600多种),还有只有2个种的Gymnarrhenoideae!这个表格也没有统计属的数目。



以欧亚旋复花的检索结果为例:

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信息还是比较多的,这个种还给了模式的信息。原以为名称的文献details会链接到原文,结果只是链接到该出版物发表的所有菊科名称list页面上。

但关键有用的信息还比较少,没有描述,图片、照片等等。看了一下主目录下的标本,结果整个数据库现在只有100多个标本记录,还都是文字资料,没有照片。


检索界面不够简化,检索结果出来得相当慢(当然也可能是访问外网的网速问题),结果显示(比如分布)也不够直观、友好。总的来说,与POWO(http://www.plantsoftheworldonline.org/)等数据库来说,只是在名称呈现上显得更专业些,但内容上比较干瘪。所以大概只有做菊科分类的人,偶尔可能会用这个网站查查。如果你检索的属种属于菊苣族Cichorieae的话,推荐另一个数据库:http://cichorieae.e-taxonomy.net/portal/node/8


GCD这个数据库中菊科目前的接受种是32872种。对比一下TPL(http://theplantlist.org/)上的菊科统计数字,很接近(整个数据库已不再更新,源数据基本都来自GCC,尽管没有分亚科,但统计数字更一目了然,统计数字一目了然):


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到底有多少种这个本底资料很重要,比如回答菊科与兰科到底谁是第一个大科,这个问题似乎就争论不休,没有定论。一般论文在引言中介绍菊科时,说菊科是被子植物最大的科也许不会被审稿人揪出来,但更准确的表达是真双子叶植物中最大的一个科,或者说与兰科是被子植物中最大的两个科。Panero et al. (2016)一文就直言菊科是排在兰科之后的第二大亚科,只有23,600种。而TPL与GCD的接受种数都超过3万种了(TPL接受的兰科物种数27891)。菊科的种数存在争议,主要的一个原因是菊科中无融合生殖的种如何处理,例如山柳菊属Hieracium、细毛菊属Pilosella、蒲公英属Taraxacum的分类,另外很多大属比较准确的物种数也不太容易整理出来,比如超大属千里光属Senecio(约1200)、传统的斑鸠菊属Vernonia(约1000种,加“传统”限定词是因为该属现被拆得太厉害,还没有被广泛接受)。


但无疑问的是菊科中属的数目大大超过兰科,两倍还要多。菊科 vs. 兰科属数:1620 vs. 765(最新的世界属志)、POWO(1679 vs. 735)、1911 vs. 899(TPL)。


被子植物最大的两个科,一个双子叶,主要在温带、开阔生境;一个单子叶,主要在热带、林下。这蛮有意思。种数差不多(姑且这么认为),为何属的数目差别那么大?如果把这两个科的分化、多样性速率分析分析,比较比较,也许会发现一些有意思的pattern。 


注:TPL, POWO, GCD的统计数字均为本日检索。







https://wap.sciencenet.cn/blog-56870-1257555.html

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1 杨卫东

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