计算机辅助翻译软件OmegaT

李继存 2018-11-16 12:05

2018-11-15 21:52:54 最近在翻译文档的时候整理了一下操作流程, 顺便完成了几个脚本以加快操作, 这里简单记录一下供参考. 计算机辅助翻译(CAT)的概念早就有了, 指的是翻译时借助计算机的记忆功能提供一些方便的操作, 如提供机器翻译, 词汇查询, 搜索以前的类似翻译等. 在我看来, CAT最主要的功能有两点, 提 ...

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GROMACS输入文件模板

李继存 2018-10-26 12:03

2018-10-25 22:33:04 在翻译整理文档的时候忽然想到, 以前创建gromacs输入文件的时候都是先复制以前的文件, 然后修改一下. 这样的事不知做过多少次了. 为什么不做一个gromacs输入文件的模板, 将它集成到我用的文本编辑器notepad2-mod中呢? 想了一下, 还算好实现, 就翻出notepad2-mod的源码, 照猫画虎地加了一 ...

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AMBER 2015伦敦研讨会 - 组合聚类分析示例

李继存 2018-10-15 06:22

者: Daniel R. Roe, 原文地址 2018-10-14 17:15:49 翻译: 刘恒江; 校对: 李继存 使用CPPTRAJ进行聚类/团簇分析 从分子动力学模拟中确定结构布居数目(structure populations)的一种方法是聚类/团簇分析. 聚类/团簇化是一种对数据进行分区的方法, 也就是将部分具有相似性的数据点从其他数据点中区分 ...

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三维空间随机旋转

李继存 2018-10-8 11:26

2018-10-07 22:23:47 生成分子初始构型的时候, 经常需要对分子进行随机旋转. 这并不是一个困难的工作, 因为早就有成熟的方法了. 在这里我展示几种不同的实现方法, 供参考. 下面是四种不同方法分别得到的球面上的随机点 Marsaglia方法 视图:投影正交速度:&nbs ...

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gnuplot显示优化过程

李继存 2018-9-28 11:24

2018-09-27 22:06:22 测试优化算法的时候, 我们常常希望能直观地看到优化过程中每一步是如何进行的, 这样更容易发现问题. 当然, 这种方法只适用于二维函数的优化, 因为我们可以将其在平面图上表现出来. 为此, 我整理了一个gnuplot脚本, 可以显示二维函数的颜色曲面和等高线, 并在其上展示优化过程中最佳点的 ...

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模拟命令行操作的svg动画

李继存 2018-9-16 21:31

2018-09-16 08:25:12 最近看到一款可以 将 Linux 终端会话录制成 SVG 动画 的工具, 效果不错. 想着将它集成到我的脚本中, 就研究了一下它所用的svg格式. 弄明白之后, 觉得用svg来显示文字虽然性能好, 但过于麻烦, 而且文件也大, 如果直接使用js脚本来模拟显示文字, 得到的svg文件就小多了, 而且也更容易修改 ...

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Pi-Pi堆积距离和堆积角度的计算

李继存 2018-8-30 10:59

2018-08-29 21:51:38 Pi-Pi堆积的概念和意义 略 Pi-Pi堆积的表征量 表征Pi-Pi堆积的物理量一般使用两个, 距离和角度. 距离为某一组原子质心或中心到另一组原子所在平面的距离, 角度为两组原子所在平面之间的夹角. 计算这两个量就需要知道如何计算一组原子所在平面的方程. 对于完全刚性的平面组原子, 三个 ...

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科技绘图的调色板

李继存 2018-8-21 09:59

2018-08-20 20:36:41 最近作图的时候, 总觉得默认的线条颜色不是很美观, 就花了点时间, 将常见绘图软件所用的调色板整理总结了一下. 所参考的软件包括: origin2017 matlab python的matplotlib及seaborn Tableau d3 colorbrewer 网上相关的资料也有很多, 就不重复了. 下面给出我整理的 ...

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origin自动载入xvg数据作图

李继存 2018-8-7 09:41

2018-08-06 20:39:48 origin是使用很广泛的绘图软件, 用起来也很方便. 2017版本的origin 支持命令行调用, 这样我们就可以利用Windows的命令行自动执行origin载入数据并绘图, 达到双击数据文件即可出图的目的. origin自动绘图的实现参考了 利用windows批处理实现自动绘图 . 里面给出的代码我修改了一下 ...

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