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IP: 110.240.149.*   [119]warmwinter   2012-1-16 14:25
陈老师您好,抱歉再次打扰您。查看launch.html的源文件(具体信息如下)中内存最大为512兆"-Xmx512m"。且我是使用jdk1.5.0_19打开launch.jnlp,其他版本都打不开。我的C盘容量为33.2GB,可用18.3GB,电脑内存为2GB。问题是我该修改哪个地方,在Go运行之后点击visualize,才会有反应呢?因我计算机知识欠缺,总是麻烦老师,还望老师海涵。谢谢老师。
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" standalone="no"?>
<jnlp codebase="file:/C:/CiteSpaceII/3.0.R5/" href="launch.jnlp" spec="1.0+">
    <information>
        <title>CiteSpace (c) 2003-2011 Chaomei Chen</title>
        <vendor>College of Information Science and Technology, Drexel University</vendor>
        <homepage href="http://cluster.ischool.drexel.edu/~cchen/citespace/"/>
        <description>Visualizing emerging trends and patterns in scientific literature</description>
        <description kind="short">CiteSpace (c) 2003-2011 Chaomei Chen</description>

    </information>
<update check="background"/>
<security>
<all-permissions/>
</security>
    <resources>
<j2se java-vm-args="-Xmx512m" version="1.6+"/>
<jar href="CiteSpaceII.jar" main="true"/>


    <jar href="lib/jnlp.jar"/>
<jar href="lib/jcommon-1.0.16.jar"/>
<jar href="lib/jfreechart-1.0.13.jar"/>
<jar href="lib/BareBonesBrowserLaunch.jar"/>
<jar href="lib/citeseerimport.jar"/>
<jar href="lib/colt.jar"/>
<jar href="lib/hsqldb.jar"/>
<jar href="lib/Jama-1.0.2.jar"/>
<jar href="lib/jung.jar"/>
<jar href="lib/ostermillerutils_1_06_01.jar"/>
<jar href="lib/poi-3.6-20091214.jar"/>
<jar href="lib/poi-ooxml-3.6-20091214.jar"/>
<jar href="lib/poi-ooxml-schemas-3.6-20091214.jar"/>
<jar href="lib/poi-scratchpad-3.6-20091214.jar"/>
<jar href="lib/postagger-2006-01-20.jar"/>
<jar href="lib/prefuse.jar"/>
<jar href="lib/resources.jar"/>
<jar href="lib/rowset.jar"/>
<jar href="lib/weka.jar"/>
<jar href="lib/wos.jar"/>
<jar href="lib/xercesImpl.jar"/>
<jar href="lib/xmlParserAPIs.jar"/>
<jar href="lib/dom4j-1.6.1.jar"/>
<jar href="lib/geronimo-stax-api_1.0_spec-1.0.jar"/>
<jar href="lib/xmlbeans-2.3.0.jar"/>
<jar href="lib/mysql-connector-java-5.1.17-bin.jar"/>
</resources>
    <application-desc main-class="edu.drexel.citespace.CiteSpace">

    <argument>-b0.0</argument>
<argument>-unrestricted</argument>
<argument>-w</argument>
<argument>-help</argument>
</application-desc>
</jnlp>
我的回复(2012-1-19 12:15):其他人有没有类似问题,如何解决的?
IP: 220.115.247.*   [118]李春发   2012-1-15 21:44
陈老师:您好!
我是初学者,下载了citespaceII 3.0R2, 按您的安装步骤安装完毕,也安装了java软件,也将launch.jnlp中的-Xmx1024m改小了一点,但我不熟悉jnlp,没有修改其中的codebase.双击launch.jnlp后出现了一个对话框,“无法启动该应用程序”;点击详细信息出现: 错误,无法加载资源:file:/C:/CiteSpaceII/dist/launch.jnlp。点击封装异常,出现:java.io.FileNotFoundException: C:\CiteSpaceII\dist\launch.jnlp (系统找不到指定的路径。)
我换一台电脑试一试,也出现同样的问题。 (我已认真学完了你写的使用说明,也看了您的博客,但就是打不开launch.jnlp,双击CiteSpaceII后能打开proceed,但点击go后就运行不下去了。)

陈老师,我如何才能启动launch.jnlp?麻烦您能在百忙中指导,谢谢!祝新年快乐!
我的回复(2012-2-1 01:27):重新下载CiteSpaceII.zip。简化了一下。试一试。
IP: 219.239.227.*   [117]田华   2012-1-11 09:33
陈教授,您好!感谢您的回复,请问该怎样把doc格式转换成web of science格式呢?我应该先去web of science网站学习如何输入、输出文档格式?再次感谢您百忙中的帮助。
我的回复(2012-1-12 04:02):你的文献Web of Science中会有吗?如果有你直接从那儿下载最好。如果没有,你得自己想办法转,人工或程序实现都行。
IP: 219.239.227.*   [116]田华   2012-1-10 14:05
陈老师,您好!我希望使用您的citespace软件进行200篇左右英文文献摘要(我目前保存格式是doc)的关键词的聚类分析和关键词的相关分析,请问应该如何操作?十分感谢!
我的回复(2012-1-11 05:33):格式需要先转成web of science的格式。
IP: 27.187.244.*   [115]warmwinter   2012-1-9 19:36
陈老师您好,我按照博文“如何解决“Could not create the Java virtual machine”的问题”下载了2G的citespace2gb.jnlp。但双击后出现error:Could not create the Java virtual machine.error:a fatal exception has occurred.Program will exit.我需要扩展内存吗?谢谢陈老师。
我的回复(2012-1-9 21:05):那个jnlp接的是旧版本。你要直接修改3.0 R5中的launch.jnlp。另外,launch.jnlp里要求的最大内存不要太接近你的全部内存,否则满足部了的话还是启动不了。
IP: 27.186.124.*   [114]warmwinter   2012-1-8 20:37
陈老师您好,打扰了。我在重装citespace时,Go运行之后点击visualize,为什么没反应呢?谢谢老师。
我的回复(2012-1-8 21:17):试一下少量数据看是否也这样。新jnlp中的内存最大值设为512兆,可以按你的实际内存调整。
IP: 218.26.170.*   [113]shftanya   2012-1-4 18:37
尊敬的陈老师:您好!又来向您请教:
1、我的数据是自然科学类的。删减了最末尾的期刊数据源,由原来的4万余条文献缩减为2万8千条,由原来的226M缩减为149M。作CR分析时,分别选2001-2010年,出来15个聚类;选2005-2010年6年数据,则出来22个聚类。对比了两个聚类效果的标签号的内容,有共同的内容,但也有不相同的。请问,这属于正常结果吗?我应该选择哪种结果来分析?是不是10年的结果对分析知识前沿领域更具说服力。但不相同的聚类结果部分,又应做何处理?
2、数据缩减后,又尝试做KW分析,无论选top=30,或50,还是top=2o%依旧没有聚类,或cluster=1。又作了institution和country的分析,也基本同前,没有聚类。是数据有问题,还是我不会设置参数的原因(因我是初学使用者,所以基本参数我都选择默认值)?
3、虽说作institution和country等的分析时,没有聚类,但左侧数据显示正常的Freq 值,能看到比如,USA排列第一,Germany 排第二等,能否认为即使没有聚类,但这个结果可以导成EXCEL表或折线图作为“国家或机构”在这方面研究的重要程度分析的?
4、我发现即使分析CR有了聚类,但中心性几乎都=0或为数不多几个出现=0.01,0.02,这是否意味与我结果出来的聚类图中连线相对不多有关系?在拜读《科学知识图谱:方法与应用》有关使用您的软件的一章P169,连线到了几百,而我的只是几十个,top=50时,所有nodes=50,这都正常吗?如下:
1-year slices         criteria        space        nodes        links
2001-2001        top 50        81530        50        34
2002-2002        top 50        79749        50        38
2003-2003        top 50        89852        50        19
2004-2004        top 50        90115        50        21
2005-2005        top 50        101582        50        37
2006-2006        top 50        97458        50        24
2007-2007        top 50        92897        50        31
2008-2008        top 50        84025        50        51
2009-2009        top 50        75423        50        40
2010-2010        top 50        77385        50        28

5、最后还有一个:发现聚类号后面标注出现(48.04),比如#4(48.04)knowledge structure ,这在哪设置就能显示,又代表什么意思?是不是这个数值越大,中心性越强,越代表它的重要性或前沿性?
恳请陈老师能在百忙中能抽出时间回答我的问题,非常感谢!并祝您身体健康!
我的回复(2012-1-6 21:17):能说说从一开始数据是如何查的吗,by topic, source, etc.?
我的回复(2012-1-4 21:16):最关键的步骤还是数据选择的范围,是否有足够的依据。
top 50 限定了 nodes的个数最大为50. 你可以提高Top N的设置,如top N=100.
其他问题我等我有时间尽快回答。
IP: 219.142.99.*   [112]tangchenglin   2012-1-4 10:09
陈老师,我按照您的教程,一步一步做。sci下载了txt,命名为download_2001.txt。project home填了C:\Users\tcl\Desktop\test\project,data directory填了C:\Users\tcl\Desktop\test\data。可是,一点“go”,space status里的space、nodes、links全是0,什么也分析不出来。请教您怎么办?
它提示,make sure that your data files indeed include relevant information,sucn as references;try again with lower thresholds.
IP: 118.229.209.*   [111]qyf12143   2012-1-1 12:59
陈老师,路径我检查了,没有错,java也是最新版的。
可启动时还是一样的提示,还可能是其他原因吗?
谢谢陈老师的回复!
我的回复(2012-1-2 11:26):检查以下你的内存是否能满足launch.jnlp中的要求。jnlp文件可以修改。
IP: 110.178.76.*   [110]shftanya   2011-12-31 19:33
谢谢您,陈老师,我会再试试,在这儿先祝你新年快乐!
IP: 110.178.58.*   [109]shftanya   2011-12-30 23:34
陈老师,您好,2005-2010,Node types=CR,topN=40,pathfinder,15个聚类,
N=103,E=130   modularity Q=0.8428 silhouette=0.9214
我的回复(2011-12-31 11:10):N好像相对小一点。只能建议重新考虑一下数据收集的细节。
IP: 118.229.211.*   [108]qyf12143   2011-12-30 23:22
陈老师,您好。我是一名在校本科生,近期跟老师做一个信息可视化的项目,需要用到您开发的citespace,可我的电脑怎么也启动不了,我已经装了java,但每次启动launch.jnlp时,都会弹出“应用程序错误”的对话框,点击详细信息,会看到——
错误:无法加载资源:file:/C:/CitespaceII/dist/launch.jnlp
异常:
com.sun.deploy.net.FailedDownloadException: 无法加载资源:file:/C:/CiteSpaceII/dist/launch.jnlp
        at com.sun.deploy.net.DownloadEngine.actionDownload(Unknown Source)
        at com.sun.deploy.net.DownloadEngine.getCacheEntry(Unknown Source)
        at com.sun.deploy.net.DownloadEngine.getCacheEntry(Unknown Source)
        at com.sun.deploy.net.DownloadEngine.getResourceCacheEntry(Unknown Source)
        at com.sun.deploy.net.DownloadEngine.getResourceCacheEntry(Unknown Source)
        at com.sun.deploy.net.DownloadEngine.getResource(Unknown Source)
        at com.sun.deploy.net.DownloadEngine.getResource(Unknown Source)
        at com.sun.javaws.Launcher.updateFinalLaunchDesc(Unknown Source)
        at com.sun.javaws.Launcher.prepareToLaunch(Unknown Source)
        at com.sun.javaws.Launcher.prepareToLaunch(Unknown Source)
        at com.sun.javaws.Launcher.launch(Unknown Source)
        at com.sun.javaws.Main.launchApp(Unknown Source)
        at com.sun.javaws.Main.continueInSecureThread(Unknown Source)
        at com.sun.javaws.Main$1.run(Unknown Source)
        at java.lang.Thread.run(Unknown Source)
封装异常:
java.io.FileNotFoundException: C:\CiteSpaceII\dist\launch.jnlp (系统找不到指定的路径。)
        at java.io.FileInputStream.open(Native Method)
        at java.io.FileInputStream.<init>(Unknown Source)
        at java.io.FileInputStream.<init>(Unknown Source)
        at sun.net.www.protocol.file.FileURLConnection.connect(Unknown Source)
        at com.sun.deploy.net.BasicHttpRequest.doRequest(Unknown Source)
        at com.sun.deploy.net.BasicHttpRequest.doRequest(Unknown Source)
        at com.sun.deploy.net.BasicHttpRequest.doGetRequest(Unknown Source)
        at com.sun.deploy.net.DownloadEngine.actionDownload(Unknown Source)
        at com.sun.deploy.net.DownloadEngine.getCacheEntry(Unknown Source)
        at com.sun.deploy.net.DownloadEngine.getCacheEntry(Unknown Source)
        at com.sun.deploy.net.DownloadEngine.getResourceCacheEntry(Unknown Source)
        at com.sun.deploy.net.DownloadEngine.getResourceCacheEntry(Unknown Source)
        at com.sun.deploy.net.DownloadEngine.getResource(Unknown Source)
        at com.sun.deploy.net.DownloadEngine.getResource(Unknown Source)
        at com.sun.javaws.Launcher.updateFinalLaunchDesc(Unknown Source)
        at com.sun.javaws.Launcher.prepareToLaunch(Unknown Source)
        at com.sun.javaws.Launcher.prepareToLaunch(Unknown Source)
        at com.sun.javaws.Launcher.launch(Unknown Source)
        at com.sun.javaws.Main.launchApp(Unknown Source)
        at com.sun.javaws.Main.continueInSecureThread(Unknown Source)
        at com.sun.javaws.Main$1.run(Unknown Source)
        at java.lang.Thread.run(Unknown Source)
不知是何原因,迫切需要的到陈老师您的解答!
我的回复(2011-12-31 23:33):核对一下文件的路径:
C:\CiteSpaceII\dist\launch.jnlp
也可以重装最新的java试试.
IP: 202.99.219.*   [107]shftanya   2011-12-28 10:13
topN% 上限是100
看一下下列信息:
N=137
modularity Q=0.44
silhouette=0.064
.
我的回复(2011-12-29 09:22):如果这是用slice=1得到的,这比一般类似数据量下生成的网络小很多。数据是关于自然科学领域吗?
IP: 202.99.219.*   [106]shftanya   2011-12-27 16:09
陈老师,您好,我用.CiteSpace 3.0.R2 ,做关键词分析,2001-2010,topN%=20%,数据量为四万余条,pathfinder,可视化图形只有两个聚类,算正常吗?
我的回复(2011-12-28 00:09):topN% 上限是多少?
看一下下列信息:
N=?
modularity=?
silhouette=?
IP: 27.18.28.*   [105]haufull   2011-12-27 01:31
收到。呵呵。
IP: 27.18.253.*   [104]haufull   2011-12-25 11:01
陈老师,Merry Christmas,新年快乐。
citespace对一个领域做了DCA聚类分析之后,对较大的聚类做了
cluster members == cited references == intellectual base
cluster makers == citing articles == research fronts
知识基础和研究前沿分析,那么这些研究前沿可以代表本领域的研究前沿吗?是根据burst term得到的吗?
我的回复(2011-12-26 23:30):节日快乐。
此前沿可代表本领域的主要研究前沿,是由其对偶关系决定的,即在知识基础上的新知识。在Cluster Explorer中这个关系是由左,中两列文献表示的。
IP: 123.185.223.*   [103]魏新岗   2011-12-25 10:24
您好陈老师:
    我想问一下,如果对国外的某本杂志做主题热点的研究,怎样使用您这一软件
我的回复(2011-12-31 23:23):看一下:http://cluster.ischool.drexel.edu/~cchen/citespace/videos/
IP: 27.18.178.*   [102]haufull   2011-12-23 22:05
好的,我知道了,陈老师,谢谢您。
IP: 27.18.35.*   [101]haufull   2011-12-23 17:02
陈老师,我在DCA聚类分析中,按步骤做到了Cluster Explorer,但是无法做到像您的著作《The Structure and Dynamics of Co‐Citation Clusters:A Multiple‐Perspective Co‐Citation Analysis》中,从最大的聚类中找到cited references as the Intellectual Base或者Citing Articles as Research Fronts,那些cited reference还有citing article是怎么找出来的?我在cluster explorer中可以找到每个聚类的cluster members还有cluster makers。cluster members中有author但是title下面都是省略号“.....”。cluster makers显示正常,下面的文献是不是应该对应的是citing article呢?谢谢陈老师,我的每步都是在您的指导下完成的,真心感谢您,真想拜您当导师。
我的回复(2011-12-23 21:39):cluster members == cited references == intellectual base
cluster makers == citing articles == research fronts
cited references的title你要逐个找一下,最简单的办法是在网络中找到相应的节点,右键》DOI, 或Google Scholar来找title.
IP: 27.18.77.*   [100]haufull   2011-12-23 11:07
数据不是按期刊搜索的,就是按主题搜索的,也可能是实际就是如此吧,我正在试聚类分析,谢谢陈老师。

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