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能导入MySQL数据的水稻GFF文件

已有 3558 次阅读 2014-7-7 16:28 |个人分类:linux|系统分类:科研笔记

ftp://ftp.gramene.org/pub/gramene/release41/data/gff/

刚试过了,至少这个文件,能用bp_seqfeature_load.pl,成功导入MySQL数据库

oryza_sativa_japonica.gff


前面试过两个其它GFF3格式的文件,从报错。对的东西终于来了.

这个目录下的其它gff文件:

amborella_trichopoda.gff34.4 MB14-5-9 上午9:18:00

arabidopsis_lyrata.gff54.7 MB14-5-9 上午9:18:00

arabidopsis_thaliana.gff49.1 MB14-5-9 上午9:18:00

brachypodium_distachyon.gff41.8 MB14-5-9 上午9:18:00

brassica_rapa.gff52.7 MB14-5-9 上午9:18:00

chlamydomonas_reinhardtii.gff28.1 MB14-5-9 上午9:18:00

cyanidioschyzon_merolae.gff1.6 MB14-5-9 上午9:18:00

glycine_max.gff107 MB14-5-9 上午9:18:00

hordeum_vulgare.gff75.8 MB14-5-9 上午9:18:00

leersia_perrieri.gff3.2 MB14-5-9 上午9:18:00

medicago_truncatula.gff43.8 MB14-5-9 上午9:18:00

musa_acuminata.gff55.4 MB14-5-9 上午9:18:00

oryza_barthii.gff61.6 MB14-5-9 上午9:18:00

oryza_brachyantha.gff39.2 MB14-5-9 上午9:18:00

oryza_glaberrima.gff49.9 MB14-5-9 上午9:18:00

oryza_glumaepatula.gff67.5 MB14-5-9 上午9:18:00

oryza_granulata.gff4.8 MB14-5-9 上午9:18:00

oryza_longistaminata.gff3.2 MB14-5-9 上午9:18:00

oryza_meridionalis.gff59.7 MB14-5-9 上午9:18:00

oryza_minutabb.gff2.9 MB14-5-9 上午9:18:00

oryza_minutacc.gff3.4 MB14-5-9 上午9:18:00

oryza_nivara.gff69.6 MB14-5-9 上午9:18:00

oryza_officinalis.gff3.4 MB14-5-9 上午9:18:00

oryza_punctata.gff63.4 MB14-5-9 上午9:18:00

oryza_rufipogon3s.gff3.2 MB14-5-9 上午9:18:00

oryza_rufipogon_fpc.gff132 B14-5-9 上午9:18:00

oryza_sativa_indica.gff58.6 MB14-5-9 上午9:18:00

oryza_sativa_japonica.gff62.3 MB14-5-9 上午9:18:00

physcomitrella_patens.gff50.2 MB14-5-9 上午9:18:00

populus_trichocarpa.gff59.9 MB14-5-9 上午9:18:00

setaria_italica.gff45.8 MB14-5-9 上午9:18:00

solanum_lycopersicum.gff42.3 MB14-5-9 上午9:18:00

solanum_tuberosum.gff60.4 MB14-5-9 上午9:18:00

sorghum_bicolor.gff40.4 MB14-5-9 上午9:18:00

triticum_aestivum.gff147 MB14-5-9 上午9:18:00

triticum_urartu.gff47.2 MB14-5-9 上午9:18:00

vitis_vinifera.gff39.9 MB14-5-9 上午9:18:00

zea_mays.gff81.5 MB14-5-9 上午9:18:00




https://wap.sciencenet.cn/blog-479743-809766.html

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