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blast 本地化 格式化数据库 自建数据库 formatdb

2016-8-5 03:36

formatdb 参考： 博耘生物 » 《blast本地化：格式化数据库（formatdb详解）》 参考： http://boyun.sh.cn/bio/?p=1483 格式一个蛋白质数据库 formatdb -i protein_db_file_name.fasta -p T -o T 格式一个核酸数据库 formatdb -i acgt_db_file_name.fasta -p F -o T

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python 复制到linux 错误 : No such file or directory

2016-7-20 22:52

参考： http://www.cnblogs.com/HeDaoYiWenZi/articles/2855965.html 该文有详细的描述。 解决方案： 运行 　dos2unix a.txt 问题描述： 在window下写好的python 脚本，复制到linux下运行时，出现如下错误： No such file or directory. 问题原因: 脚本的首行 ...

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sendmail 命令

2016-5-23 07:41

sendmail 命令 CliffGao 参考： http://blog.csdn.net/kevinew/article/details/9147969 cat yourEmailContent.txt uuencode yourAttachment.txt |sendmail -t SentEmailName@example.com yourEmailContent.txt 内部可以指定发件人、主题等： From: fromEmailName@example.co ...

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biopython 中文教程

2016-4-28 14:08

biopython 中文教程 http://biopython-cn.readthedocs.io/en/latest/cn/chr01.html 比对模块 http://biopython.org/DIST/docs/api/Bio.pairwise2-module.html from Bio import pairwise2 alignments = pairwise2.align.globalxx( ACCGT , ACG )

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xmgrace

2016-4-20 16:03

xmgrace 参考: http://blog.sciencenet.cn/blog-548663-912350.html 1. 画多条曲线 文件有多列 x, y1, y2; 文件必须空格分开. xmgrace -nxy filename. 2. 指定列作图 xmgrace -block file.dat -bxy 1:3 3. 制作散点图 xmgrace a.txt a.txt 0 1 1 2 2 3 如果有多个文件数 ...

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sed

2016-4-17 15:13

Sed 是 stream editor 简称. 1. 替换 sed 's/day/night/' old new 2 斜杠(/)作为分隔符 s 后面的字符常用做分隔符. 通常我们会使用斜杠(/). 当然你可以使用任何的符号. 例如我们将目录/usr/local/bin 换为 /common/bin . 你需要使用反斜杠()来引用斜杠. s ...

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谬误- 人身攻击

2016-4-16 07:08

谬误-人身攻击 against the man 谬误形式: 1. 某人A断言X 2. 某人B 攻击某人A 3. 所以A的断言是错误的. 该谬误之所以错误,是因为 做断言人的性格 环境 动作并不能 导致断言是错或对. 参考 http://www.nizkor.org/features/fallacies/ad-hominem.html

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另外一种 反正切函数

2016-4-10 07:44

另外一种反正切函数 atan2(y,x) 我们常见的 y=arctan(x), 值域 (− π 2 , π 2 ), 而z=arctan2(y,x) 值域 为 (−π, π] . 参考: https://en.wikipedia.org/wiki/Atan2

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谬误--诉诸众人

2016-4-10 07:14

Appeal to Popularity: 诉诸众人: 1. 多数人赞成X 2.所以X是正确的. 区别: Appeal to Popularity: 该谬误是诉诸 多数人赞成断言X的事实. (most people approve of a claim) Appeal to Belief: 该谬误诉诸 多数人相信断言的事实. (most people believe a claim) Appeal to Common P ...

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