薛堪豪的个人博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/bfax 兴趣:凝聚态物理,电化学

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2014年7月29日发布的能源与电化学类 SCI 期刊影响因子
2014-8-1 06:52
仅供参考。 期刊 影响因子 Annual Review of Physical Chemistry 15.678 Energy Environmental Science 15.49 Advanced Energy Materials 14.385 Nano Energy 10.211 ChemSusChem 7.117 Green Chemistry 6.852 Journal ...
个人分类: 论文|5743 次阅读|没有评论
给矢量图瘦身
热度 2 2014-7-28 21:38
最近遇到矢量图细节过多,文件太大以至于电脑内存不够,无法操作的问题。 根据定义,矢量图无论如何缩放都不会损失细节,所以应该是很难瘦身的。 然而,我发现通过软件的限制,还是可以瘦身。我将要操作的矢量图缩小到很小(5%),关闭再重新打开。这时,系统的内存占用率大幅下降,说明一些细节已经损失了。原因是:小 ...
个人分类: 论文|2600 次阅读|3 个评论 热度 2
Gromacs 有机溶剂模拟 学习笔记(二)
热度 1 2014-7-20 23:49
上次混合两种溶剂的方法过于笨拙,所以这次我们改用 packmol 软件来混合。 我们的目的是:用分子动力学方法证明 正 辛醇不溶于水。 packmol 在 Linux 下的安装比较简单,不再赘述。 首先下载正辛醇的拓扑文件: wget http://virtualchemistry.org/molecules/67-68-5/OPLS/oplsaaff.itp wge ...
个人分类: 物理|5057 次阅读|1 个评论 热度 1
Gromacs 有机溶剂模拟 学习笔记(一)
2014-7-3 02:06
初学 Gromacs,觉得其手册非常难懂,幸好有同学帮忙。感谢 Deng Yue 和 Matias 的帮助。 Gromacs 的设计理念应该是为了方便生物大分子的模拟,而我则需要用它来模拟有机溶剂。 第一次运行的操作笔记 目的:建立两种有机溶剂的混合溶液,这里以 DMSO 和 DME 为例 操作方法: Step 1: 先 ...
个人分类: 物理|6412 次阅读|没有评论
VASP 与 Siesta 晶体结构格式互换
2014-6-28 00:58
如果手动进行 VASP 与 Siesta 之间的坐标转换,面临两个较麻烦的手续: (1)VASP 的 POSCAR 中,每个原子坐标后面一般没有元素的标识(1,2 ...) (2)Siesta 的 fdf 文件中,各个原子未必是按照元素次序排列的。并且还需要统计各个元素分别有多少个原子。 为了提高效率,我就写两个 Python 小程序以便在 Linux 下进 ...
个人分类: 计算机|3690 次阅读|没有评论
出版社是如何处理论文图片的?
2014-6-11 00:55
当今电子时代,写论文的时候,最重要的是希望在线的 PDF 文件能够显示清晰,而书面印刷质量倒是次要的。 于是乎,我就喜欢采用原生的矢量图格式。无论是示意图,还是数据曲线图,都可以完全采用矢量图。 但投稿的时候有些细节丰富的矢量图有几十 MB 之大。出版社却会将最终的 PDF 文件神奇般地缩到只有几个 MB。 我一 ...
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